pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython false Birds genome false Source data for tree(s) 'tree1' tree1 ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:bootstrapValues ^ot:comment highestMintedElementIDs ^ot:nodeLabelDescription ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis Joseph W. Brown James Waterford 81461 Aves ot_1055 Reddy, Sushma, Rebecca T. Kimball, Akanksha Pandey, Peter A. Hosner, Michael J. Braun, Shannon J. Hackett, Kin-Lan Han, John Harshman, Christopher J. Huddleston, Sarah Kingston, Ben D. Marks, Kathleen J. Miglia, William S. Moore, Frederick H. Sheldon, Christopher C. Witt, Tamaki Yuri, Edward L. Braun. 2017. Why do phylogenomic data sets yield conflicting trees? Data type influences the avian tree of life more than taxon sampling. Systematic Biology 2017 Struthio camelus genome 647692 Struthio camelus Dromaius novaehollandiae 829513 Dromaius novaehollandiae Phegornis mitchellii 214792 Phegornis mitchellii Charadrius vociferus genome 661811 Charadrius vociferus Turnix sylvaticus 810658 Turnix sylvaticus Larus marinus 887691 Larus marinus Glareola cinerea 3596816 Glareola cinerea Dromas ardeola 383929 Dromas ardeola Arenaria interpres 821753 Arenaria interpres Thinocorus orbignyianus 628490 Thinocorus orbignyianus Pedionomus torquatus 163953 Pedionomus torquatus Jacana jacana 332005 Jacana jacana Casuarius casuarius 589152 Casuarius casuarius Rostratula benghalensis 5276 Rostratula benghalensis Opisthocomus hoazin genome 928360 Opisthocomus hoazin Nyctibius grandis 178249 Nyctibius grandis Nyctibius bracteatus 178250 Nyctibius bracteatus Steatornis caripensis 701548 Steatornis caripensis Batrachostomus septimus 624321 Batrachostomus septimus Podargus strigoides 313120 Podargus strigoides Eurostopodus mystacalis 798642 Eurostopodus mystacalis Lyncornis macrotis 483809 Eurostopodus macrotis Antrostomus carolinensis genome 416426 Caprimulgus carolinensis Chauna torquata 860132 Chauna torquata Systellura longirostris 7068108 Systellura longirostris Aegotheles cristatus 540033 Aegotheles cristatus Aegotheles insignis 331487 Euaegotheles insignis Hemiprocne mystacea 174365 Hemiprocne mystacea Streptoprocne zonaris 697414 Streptoprocne zonaris Chaetura pelagica genome 609785 Chaetura pelagica Aerodramus vanikorensis 332662 Aerodramus vanikorensis Colibri coruscans 804120 Colibri coruscans Calypte anna genome 810756 Calypte anna Topaza pella 664346 Topaza pella Anseranas semipalmata 714464 Anseranas semipalmata Phaethornis griseogularis 51272 Phaethornis griseogularis Phaethon rubricauda 509057 Phaethon rubricauda Phaethon lepturus genome 855119 Phaethon lepturus Rhynochetos jubatus 86672 Rhynochetos jubatus Eurypyga helias genome 86680 Eurypyga helias Sarcoramphus papa 819160 Sarcoramphus papa Cathartes aura genome 9106 Cathartes aura Sagittarius serpentarius 1036186 Sagittarius serpentarius Pandion haliaetus 509837 Pandion haliaetus Gampsonyx swainsonii 767826 Gampsonyx swainsonii Anser erythropus 691333 Anser erythropus Elanoides forficatus 1053065 Elanoides forficatus Aquila chrysaetos genome 263127 Aquila chrysaetos Buteo jamaicensis 509839 Buteo jamaicensis Haliaeetus leucocephalus genome 1012350 Haliaeetus leucocephalus Haliaeetus albicilla genome 263118 Haliaeetus albicilla Strix occidentalis 273899 Strix occidentalis Athene cunicularia 944695 Athene cunicularia Tyto alba genome 1065606 Tyto alba Phodilus badius 842854 Phodilus badius Urocolius indicus 1094061 Urocolius indicus Biziura lobata 432041 Biziura lobata Colius striatus genome 462544 Colius striatus Colius colius 462548 Colius colius Leptosomus discolor genome 897867 Leptosomus discolor Apaloderma narina 392077 Apaloderma narina Apaloderma vittatum genome 291857 Apaloderma vittatum Trogon personatus 284302 Trogon personatus Pharomachrus auriceps 917902 Pharomachrus auriceps Bucorvus abyssinicus 991309 Bucorvus abyssinicus Tockus camurus 383917 Tockus camurus Buceros rhinoceros silvestris genome 785190 Buceros rhinoceros silvestris Oxyura jamaicensis 88378 Oxyura jamaicensis Upupa epops 412129 Upupa epops Rhinopomastus cyanomelas 49610 Rhinopomastus cyanomelas Phoeniculus purpureus 238765 Phoeniculus purpureus Merops nubicus genome 989087 Merops nubicus Nyctyornis amictus 524018 Nyctyornis amictus Brachypteracias squamiger 3596417 Brachypteracias squamiger Coracias caudatus 244691 Coracias caudatus Todus angustirostris 986892 Todus angustirostris Momotus momota 989081 Momotus momota Corythornis leucogaster 3596453 Corythornis leucogaster Malacorhynchus membranaceus 1082830 Malacorhynchus membranaceus Chloroceryle aenea 986901 Chloroceryle aenea Dacelo novaeguineae 938422 Dacelo novaeguineae Brachygalba albogularis 3600688 Brachygalba albogularis Galbula albirostris 383931 Galbula albirostris Nonnula ruficapilla 3600711 Nonnula ruficapilla Malacoptila fusca 574523 Malacoptila fusca Bucco macrodactylus 960235 Bucco macrodactylus Psilopogon virens 6154913 Psilopogon virens Capito niger 1068254 Capito niger Pogoniulus bilineatus 291639 Pogoniulus bilineatus Aythya americana 693332 Aythya americana Indicator maculatus 552486 Indicator maculatus Prodotiscus insignis 266357 Prodotiscus insignis Jynx ruficollis 3600188 Jynx ruficollis Picoides pubescens genome 873958 Picoides pubescens Dryocopus pileatus 733984 Dryocopus pileatus Chunga burmeisteri 3600042 Chunga burmeisteri Cariama cristata genome 86685 Cariama cristata Micrastur semitorquatus 1015189 Micrastur semitorquatus Herpetotheres cachinnans 438655 Herpetotheres cachinnans Daptrius ater 438664 Daptrius ater Anas platyrhynchos genome 765167 Anas platyrhynchos Falco mexicanus 183625 Falco mexicanus Falco cherrug genome 1001807 Falco cherrug Falco peregrinus genome 786435 Falco peregrinus Nestor notabilis genome 749203 Nestor notabilis Cacatua sulphurea 290348 Cacatua sulphurea Psittacus erithacus 285641 Psittacus erithacus Ara macao genome 851014 Ara macao Amazona autumnalis 636288 Amazona autumnalis Platycercus elegans 224308 Platycercus elegans Melopsittacus undulatus genome 734818 Melopsittacus undulatus Eudromia elegans 292461 Eudromia elegans Alectura lathami 570956 Alectura lathami Chalcopsitta cardinalis 276605 Chalcopsitta cardinalis Micropsitta finschii 989085 Micropsitta finschii Alisterus scapularis 183243 Alisterus scapularis Psittacula alexandri 753626 Psittacula alexandri Acanthisitta chloris genome 1085740 Acanthisitta chloris Smithornis rufolateralis 592204 Smithornis rufolateralis Sapayoa aenigma 395861 Sapayoa aenigma Hydrornis guajanus 4947551 Hydrornis guajanus Manacus vitellinus genome 640833 Manacus vitellinus Lepidothrix coronata 49248 Lepidothrix coronata Megapodius eremita 570964 Megapodius eremita Tyrannus tyrannus 463183 Tyrannus tyrannus Mionectes macconnelli 1015939 Mionectes macconnelli Thamnophilus nigrocinereus 413004 Thamnophilus nigrocinereus Grallaria varia 1091665 Grallaria varia Dendrocolaptes certhia 584977 Dendrocolaptes certhia Scytalopus magellanicus 44861 Scytalopus magellanicus Menura novaehollandiae 531206 Menura novaehollandiae Climacteris erythrops 310385 Climacteris erythrops Malurus melanocephalus 959440 Malurus melanocephalus Nucifraga columbiana genome 425442 Nucifraga columbiana Crax alector 654722 Crax alector Corvus corone 711844 Corvus corone Corvus brachyrhynchos genome 331952 Corvus brachyrhynchos Picathartes gymnocephalus 699623 Picathartes gymnocephalus Sylvia nana 7068651 Curruca nana Pseudopodoces humilis genome 875992 Pseudopodoces humilis Turdus falcklandii 381315 Turdus falcklandii Ficedula albicollis genome 107840 Ficedula albicollis Regulus calendula 3599890 Regulus calendula Bombycilla garrulus 613881 Bombycilla garrulus Ploceus cucullatus 370802 Ploceus cucullatus Numida meleagris 684046 Numida meleagris Taeniopygia guttata genome 708327 Taeniopygia guttata Vidua chalybeata 622887 Vidua chalybeata Passer montanus 44870 Passer montanus Fringilla montifringilla 28332 Fringilla montifringilla Zonotrichia albicollis genome 265547 Zonotrichia albicollis Geospiza fortis genome 589951 Geospiza fortis Colinus cristatus 520556 Colinus cristatus Colinus virginianus genome 204709 Colinus virginianus Rollulus rouloul 352755 Rollulus rouloul Meleagris gallopavo genome 446482 Meleagris gallopavo Centrocercus minimus genome 909953 Centrocercus minimus Gallus gallus genome 153563 Gallus gallus Nothoprocta perdicaria 402446 Nothoprocta perdicaria Coturnix coturnix 1098760 Coturnix coturnix Coturnix japonica genome 803622 Coturnix japonica Treron vernans 329083 Treron vernans Otidiphaps nobilis 543760 Otidiphaps nobilis Columbina passerina 157208 Columbina passerina Geotrygon montana 664480 Geotrygon montana Columba livia genome 938416 Columba livia Podiceps auritus 726164 Podiceps auritus Podiceps cristatus genome 92263 Podiceps cristatus Phoenicopterus chilensis 960220 Phoenicopterus chilensis Nothocercus nigrocapillus 3600813 Nothocercus nigrocapillus Phoenicopterus ruber genome 443650 Phoenicopterus ruber Mesitornis unicolor genome 966316 Mesitornis unicolor Monias benschi 582941 Monias benschi Pterocles namaqua 322445 Pterocles namaqua Pterocles gutturalis genome 57819 Pterocles gutturalis Syrrhaptes paradoxus 817590 Syrrhaptes paradoxus Eupodotis ruficrista 5031 Lophotis ruficrista Chlamydotis macqueenii genome 787600 Chlamydotis macqueenii Ardeotis kori 521837 Ardeotis kori Crotophaga sulcirostris 1041415 Crotophaga sulcirostris Crypturellus soui 960236 Crypturellus soui Tapera naevia 933123 Tapera naevia Geococcyx californianus 212182 Geococcyx californianus Coua cristata 787074 Coua cristata Centropus viridis 212748 Centropus viridis Cuculus canorus genome 792628 Cuculus canorus Phaenicophaeus curvirostris 1041420 Phaenicophaeus curvirostris Coccyzus americanus 891425 Coccyzus americanus Heliornis fulica 440618 Heliornis fulica Sarothrura elegans 399792 Sarothrura elegans Rallus limicola 502780 Rallus limicola Tinamus guttatus genome 306216 Tinamus guttatus Himantornis haematopus 383918 Himantornis haematopus Psophia crepitans 915643 Psophia crepitans Aramus guarauna 1095362 Aramus guarauna Grus canadensis 257929 Grus canadensis Balearica regulorum gibbericeps genome 476947 Balearica regulorum gibbericeps Tauraco erythrolophus genome 487306 Tauraco erythrolophus Crinifer piscator 198692 Crinifer piscator Corythaeola cristata 842345 Corythaeola cristata Gavia immer 1057518 Gavia immer Gavia stellata genome 1057044 Gavia stellata Rhea pennata 857860 Pterocnemia pennata Aptenodytes forsteri genome 494370 Aptenodytes forsteri Aptenodytes patagonicus 494361 Aptenodytes patagonicus Pygoscelis adeliae genome 494357 Pygoscelis adeliae Eudyptula minor 613299 Eudyptula minor Phoebastria nigripes 320288 Phoebastria nigripes Oceanites oceanicus 656591 Oceanites oceanicus Oceanodroma tethys 603905 Hydrobates tethys Fulmarus glacialis genome 1028832 Fulmarus glacialis Pelecanoides urinatrix 904486 Pelecanoides urinatrix Puffinus griseus 726166 Puffinus griseus Rhea americana 857864 Rhea americana Ciconia ciconia 363031 Ciconia ciconia Mycteria americana 464695 Mycteria americana Fregata magnificens 330000 Fregata magnificens Sula leucogaster 1030310 Sula leucogaster Morus bassanus 675103 Morus bassanus Phalacrocorax carbo genome 969841 Phalacrocorax carbo Anhinga anhinga 170196 Anhinga anhinga Eudocimus albus 425447 Eudocimus albus Nipponia nippon genome 946418 Nipponia nippon Platalea ajaja 951123 Platalea ajaja Apteryx australis 241834 Apteryx australis Cochlearius cochlearius 154815 Cochlearius cochlearius Ardea herodias 744564 Ardea herodias Egretta garzetta genome 273425 Egretta garzetta Balaeniceps rex 464697 Balaeniceps rex Scopus umbretta 464704 Scopus umbretta Pelecanus crispus genome 427900 Pelecanus crispus Pelecanus occidentalis 329999 Pelecanus occidentalis Chionis albus 5857115 Chionis albus Burhinus bistriatus 57829 Burhinus bistriatus Haematopus palliatus 1092987 Haematopus palliatus ot:substitutionCount Maximum likelihood node1 ot:bootstrapValues node1 false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true 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