pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython Birds false Source data for tree(s) 'tree1' tree1 ^ot:comment ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis Joseph W. Brown 1041547 Passeriformes ot_1195 Hooper, Daniel M., Trevor D. Price. 2017. Chromosomal inversion differences correlate with range overlap in passerine birds. Nature Ecology & Evolution 1 (10): 1526-1534 2017 Zonotrichia atricapilla 265554 Zonotrichia atricapilla Spizelloides arborea 463026 Spizella arborea Volatinia jacarina 946790 Volatinia jacarina Piranga flava 1041102 Piranga flava Piranga rubra 1075670 Piranga rubra Cardinalis sinuatus 425446 Cardinalis sinuatus Cardinalis cardinalis 307364 Cardinalis cardinalis Pheucticus melanocephalus 425436 Pheucticus melanocephalus Pheucticus aureoventris 874353 Pheucticus aureoventris Cyanocompsa brissonii 486836 Cyanocompsa brissonii Spinus spinus 167338 Spinus spinus Spinus psaltria 957575 Spinus psaltria Passerella iliaca 789028 Passerella iliaca Serinus canaria 464865 Serinus canaria Carduelis carduelis 1083719 Carduelis carduelis Acanthis flammea 38566 Acanthis flammea Loxia curvirostra 298778 Loxia curvirostra Linaria cannabina 637969 Carduelis cannabina Chloris ambigua 957580 Carduelis ambigua Chloris chloris 1083715 Carduelis chloris Chloris sinica 28346 Chloris sinica Haemorhous mexicanus 711865 Haemorhous mexicanus Bucanetes githagineus 59188 Bucanetes githagineus Melozone fusca 463029 Kieneria fusca Bucanetes mongolicus 235463 Eremopsaltria mongolica Pyrrhula pyrrhula 1083726 Pyrrhula pyrrhula Carpodacus erythrinus 815418 Carpodacus erythrinus Carpodacus roseus 815419 Carpodacus roseus Eophona personata 341474 Eophona personata Eophona migratoria 341465 Eophona migratoria Coccothraustes coccothraustes 1083711 Coccothraustes coccothraustes Fringilla montifringilla 28332 Fringilla montifringilla Fringilla coelebs 828694 Fringilla coelebs Anthus trivialis 695340 Anthus trivialis Melozone aberti 463022 Kieneria aberti Anthus hodgsoni 28330 Anthus hodgsoni Anthus spinoletta 695342 Anthus spinoletta Anthus rufulus 3597135 Anthus rufulus Motacilla alba 695336 Motacilla alba Motacilla maderaspatensis 483332 Motacilla madaraspatensis Motacilla flava 645461 Motacilla flava Motacilla cinerea 489154 Motacilla cinerea Passer hispaniolensis 9416 Passer hispaniolensis Passer domesticus 745175 Passer domesticus Passer montanus 44870 Passer montanus Pipilo erythrophthalmus 453762 Pipilo erythrophthalmus Gymnoris xanthocollis 3597468 Gymnoris xanthocollis Montifringilla davidiana 96152 Montifringilla davidiana Montifringilla nivalis 567983 Montifringilla nivalis Petronia petronia 407760 Petronia petronia Lonchura atricapilla 4085 Lonchura atricapilla Lonchura maja 290806 Lonchura maja Lonchura malacca 474148 Lonchura malacca Lonchura castaneothorax 24025 Lonchura castaneothorax Lonchura flaviprymna 3597677 Lonchura flaviprymna Lonchura striata 306760 Lonchura striata Artemisiospiza belli 292639 Amphispiza belli Lonchura punctulata 865474 Lonchura punctulata Lonchura oryzivora 453058 Padda oryzivora Euodice malabarica 596766 Lonchura malabarica Euodice cantans 596772 Lonchura cantans Spermestes bicolor 998135 Lonchura bicolor Poephila acuticauda 925513 Poephila acuticauda Poephila cincta 543844 Poephila cincta Poephila personata 813444 Poephila personata Taeniopygia guttata 708327 Taeniopygia guttata Stizoptera bichenovii 1019789 Taeniopygia bichenovii Peucaea botterii 24666 Peucaea botterii Aidemosyne modesta 311555 Aidemosyne modesta Bathilda ruficauda 918908 Neochmia ruficauda Emblema pictum 1082386 Emblema pictum Neochmia phaeton 918911 Neochmia phaeton Neochmia temporalis 918913 Neochmia temporalis Stagonopleura guttata 543841 Stagonopleura guttata Heteromunia pectoralis 596770 Heteromunia pectoralis Amandava amandava 393085 Amandava amandava Amandava subflava 276881 Amandava subflava Amadina erythrocephala 393083 Amadina erythrocephala Peucaea cassinii 961462 Aimophila cassinii Amadina fasciata 393090 Amadina fasciata Estrilda astrild 901156 Estrilda astrild Lagonosticta senegala 255281 Lagonosticta senegala Uraeginthus bengalus 95951 Uraeginthus bengalus Pytilia phoenicoptera 778432 Pytilia phoenicoptera Pytilia melba 255282 Pytilia melba Erythrura trichroa 918904 Erythrura trichroa Erythrura gouldiae 465909 Erythrura gouldiae Ploceus philippinus 865477 Ploceus philippinus Foudia madagascariensis 806353 Foudia madagascariensis Peucaea carpalis 6028 Aimophila carpalis Ploceus velatus 301061 Ploceus velatus Prunella rubida 795158 Prunella rubida Prunella montanella 95302 Prunella montanella Peucedramus taeniatus 370807 Peucedramus taeniatus Chloropsis cochinchinensis 647189 Chloropsis cochinchinensis Chloropsis aurifrons 7490 Chloropsis aurifrons Cinnyris asiaticus 4131399 Cinnyris asiaticus Oenanthe pleschanka 936541 Oenanthe pleschanka Oenanthe melanoleuca 3598219 Oenanthe melanoleuca Oenanthe deserti 619182 Oenanthe deserti Ammodramus humeralis 1027172 Ammodramus humeralis Oenanthe isabellina 33124 Oenanthe isabellina Oenanthe oenanthe 1092950 Oenanthe oenanthe Oenanthe finschii 410726 Oenanthe finschii Oenanthe chrysopygia 936546 Oenanthe chrysopygia Oenanthe picata 936539 Oenanthe picata Saxicola torquatus 825641 Saxicola torquata Saxicola insignis 173999 Saxicola insignis Monticola saxatilis 957844 Monticola saxatilis Monticola solitarius 653933 Monticola solitarius Monticola cinclorhynchus 916113 Monticola cinclorhynchus Zonotrichia leucophrys 265553 Zonotrichia leucophrys Ammodramus aurifrons 1027170 Ammodramus aurifrons Phoenicurus auroreus 33134 Phoenicurus auroreus Phoenicurus phoenicurus 1093902 Phoenicurus phoenicurus Ficedula zanthopygia 547548 Ficedula zanthopygia Ficedula narcissina 131996 Ficedula narcissina Ficedula parva 416087 Ficedula parva Ficedula mugimaki 67150 Ficedula mugimaki Enicurus leschenaulti 254683 Enicurus leschenaulti Myiomela leucura 35350 Myiomela leucura Tarsiger cyanurus 131992 Luscinia cyanura Calliope calliope 94170 Calliope calliope Amphispiza quinquestriata 630695 Aimophila quinquestriata Calliope pectoralis 408566 Calliope pectoralis Luscinia svecica 274225 Luscinia svecica Luscinia megarhynchos 961118 Luscinia megarhynchos Larvivora sibilans 45312 Luscinia sibilans Larvivora komadori 706246 Erithacus komadori Larvivora akahige 706259 Erithacus akahige Larvivora cyane 812517 Luscinia cyane Cyanoptila cyanomelana 92668 Cyanoptila cyanomelana Cyanoptila cumatilis 6152972 Cyanoptila cumatilis Muscicapa striata 116518 Muscicapa striata Amphispiza bilineata 292646 Amphispiza bilineata Copsychus fulicatus 3598207 Copsychus fulicatus Turdus naumanni 884603 Turdus naumanni Turdus eunomus 168078 Turdus eunomus Turdus ruficollis 906450 Turdus ruficollis Turdus pilaris 1050514 Turdus pilaris Turdus pallidus 653922 Turdus pallidus Turdus obscurus 653930 Turdus obscurus Turdus celaenops 906451 Turdus celaenops Turdus chrysolaus 653925 Turdus chrysolaus Turdus hortulorum 431677 Turdus hortulorum Emberiza spodocephala 613879 Schoeniclus spodocephala Turdus cardis 1076171 Turdus cardis Turdus migratorius 96291 Turdus migratorius Turdus amaurochalinus 381318 Turdus amaurochalinus Turdus leucomelas 379422 Turdus leucomelas Turdus albicollis 1058859 Turdus albicollis Turdus rufiventris 1008498 Turdus rufiventris Turdus iliacus 906449 Turdus iliacus Turdus merula 568572 Turdus merula Turdus philomelos 1082345 Turdus philomelos Geokichla sibirica 640617 Zoothera sibirica Emberiza aureola 45309 Schoeniclus aureolus Zoothera dauma 653917 Zoothera dauma Acridotheres tristis 80701 Acridotheres tristis Acridotheres fuscus 595025 Acridotheres fuscus Sturnus cineraceus 499641 Sturnus cineraceus Sturnia malabarica 844094 Sturnus malabaricus Temenuchus pagodarum 844099 Sturnus pagodarum Agropsar sturninus 848366 Sturnus sturninus Gracupica contra 844085 Sturnus contra Sturnus vulgaris 565813 Sturnus vulgaris Toxostoma rufum 293380 Toxostoma rufum Emberiza chrysophrys 846941 Emberiza chrysophrys Toxostoma curvirostre 259098 Toxostoma curvirostre Mimus saturninus 325207 Mimus saturninus Cinclus pallasii 968660 Cinclus pallasii Troglodytes aedon 293378 Troglodytes aedon Troglodytes troglodytes 259813 Troglodytes troglodytes Cantorchilus leucotis 932491 Thryothorus leucotis Polioptila melanura 443273 Polioptila melanura Certhia familiaris 1007196 Certhia familiaris Sitta europaea 82242 Sitta europaea Sitta neumayer 1076198 Sitta neumayer Emberiza pusilla 340338 Emberiza pusilla Sitta frontalis 82249 Sitta frontalis Bombycilla garrulus 613881 Bombycilla garrulus Bombycilla japonica 496029 Bombycilla japonica Bombycilla cedrorum 606625 Bombycilla cedrorum Regulus regulus 3599889 Regulus regulus Heterophasia pulchella 25704 Heterophasia pulchella Heterophasia melanoleuca 1028014 Heterophasia melanoleuca Leiothrix lutea 965458 Leiothrix lutea Actinodura cyanouroptera 6152756 Actinodura cyanouroptera Trochalopteron formosum 202834 Garrulax formosus Emberiza rutila 124457 Emberiza rutila Turdoides malcolmi 3598530 Turdoides malcolmi Turdoides striata 3598525 Turdoides striata Ianthocincla albogularis 6152785 Ianthocincla albogularis Ianthocincla poecilorhynchus 6152801 Ianthocincla poecilorhyncha Ianthocincla pectoralis 5560054 Ianthocincla pectoralis Babax lanceolatus 977751 Babax lanceolatus Ianthocincla sannio 6152803 Ianthocincla sannio Ianthocincla cineracea 1055596 Garrulax cineraceus Garrulax canorus 635111 Garrulax canorus Alcippe morrisonia 35861 Alcippe morrisonia Emberiza fucata 802893 Emberiza fucata Alcippe nipalensis 546869 Alcippe nipalensis Schoeniparus dubius 321215 Alcippe dubia Megapomatorhinus erythrogenys 25618 Erythrogenys erythrogenys Pomatorhinus ruficollis 154418 Pomatorhinus ruficollis Cyanoderma ruficeps 697082 Stachyris ruficeps Zosterops japonicus 131985 Zosterops japonicus Zosterops erythropleurus 446681 Zosterops erythropleurus Zosterops palpebrosus 446693 Zosterops palpebrosus Zosterops lateralis 819155 Zosterops lateralis Yuhina diademata 697080 Yuhina diademata Emberiza rustica 28343 Schoeniclus rusticus Paradoxornis flavirostris 3598200 Paradoxornis flavirostris Fulvetta ruficapilla 824110 Alcippe ruficapilla Chrysomma sinense 370024 Chrysomma sinense Sinosuthora webbiana 802901 Paradoxornis webbianus Sylvia communis 862895 Sylvia communis Phylloscopus schwarzi 354802 Phylloscopus schwarzi Phylloscopus affinis 930303 Phylloscopus affinis Phylloscopus fuscatus 930304 Phylloscopus fuscatus Phylloscopus inornatus 930297 Abrornis inornata Phylloscopus proregulus 930298 Abrornis proregulus Zonotrichia albicolis 265547 Zonotrichia albicollis Emberiza elegans 167343 Schoeniclus elegans Phylloscopus pulcher 930299 Phylloscopus pulcher Phylloscopus tenellipes 505346 Seicercus tenellipes Phylloscopus borealis 256518 Seicercus borealis Phylloscopus trochiloides 726314 Phylloscopus trochiloides Horornis diphone 1076190 Horornis diphone Aegithalos concinnus 819858 Aegithalos concinnus Aegithalos caudatus 467867 Aegithalos caudatus Psaltriparus minimus 1058772 Psaltriparus minimus Pycnonotus sinensis 92679 Pycnonotus sinensis Pycnonotus xanthorrhous 274931 Pycnonotus xanthorrhous Emberiza schoeniclus 711856 Emberiza schoeniclus Pycnonotus jocosus 778857 Pycnonotus jocosus Pycnonotus leucogenys 597118 Pycnonotus leucogenis Pycnonotus cafer 181049 Pycnonotus cafer Spizixos canifrons 3598336 Spizixos canifrons Spizixos semitorques 321380 Spizixos semitorques Ixos mcclellandi 274986 Ixos mcclellandii Orthotomus sutorius 353515 Orthotomus sutorius Prinia socialis 3598861 Prinia socialis Riparia riparia 922718 Riparia riparia Riparia diluta 840532 Riparia diluta Emberiza flaviventris 536142 Emberiza flaviventris Notiochelidon cyanoleuca 877579 Pygochelidon cyanoleuca Stelgidopteryx ruficollis 136035 Stelgidopteryx ruficollis Progne chalybea 136021 Progne chalybea Hirundo rustica 1040135 Hirundo rustica Hirundo smithii 487358 Hirundo smithii Cecropis daurica 641125 Cecropis daurica Acrocephalus agricola 383143 Acrocephalus agricola Acrocephalus bistrigiceps 959332 Acrocephalus bistrigiceps Acrocephalus arundinaceus 800677 Acrocephalus arundinaceus Hippolais languida 433848 Hippolais languida Emberiza leucocephalos 46691 Emberiza leucocephalos Iduna caligata 433847 Iduna caligata Locustella fluviatilis 433841 Locustella fluviatilis Locustella thoracica 1094726 Bradypterus thoracicus Locustella lanceolata 480675 Locustella lanceolata Locustella fasciolata 1016855 Locustella fasciolata Alauda gulgula 521612 Alauda gulgula Alauda arvensis 312548 Alauda arvensis Galerida cristata 207745 Galerida cristata Melanocorypha bimaculata 580150 Melanocorypha bimaculata Eremophila alpestris 998122 Eremophila alpestris Emberiza citrinella 828708 Emberiza citrinella Calandrella cinerea 3597513 Calandrella cinerea Poecile palustris 17260 Poecile palustris Poecile montanus 17269 Poecile montanus Poecile atricapillus 17262 Poecile atricapilla Sittiparus varius 613888 Poecile varius Periparus venustulus 24855 Parus venustulus Periparus ater 746130 Periparus ater Parus major 515143 Parus major Parus minor 387300 Parus minor Remiz pendulinus 746137 Remiz pendulinus Emberiza hortulana 145223 Emberiza hortulana Picathartes gymnocephalus 699623 Picathartes gymnocephalus Corvus cornix 597020 Corvus cornix Corvus corone 711844 Corvus corone Corvus brachyrhynchos 331952 Corvus brachyrhynchos Corvus culminatus 669405 Corvus culminatus Corvus mandshuricus 549510 Corvus macrorhynchos Corvus splendens 38262 Corvus splendens Corvus corax 140425 Corvus corax Corvus monedula 711848 Corvus monedula Garrulus glandarius 140432 Garrulus glandarius Emberiza cioides 367092 Emberiza cioides Pica pica 776471 Pica pica Cyanocitta cristata 30736 Cyanocitta cristata Cyanopica cyanus 636378 Cyanopica cyanus Urocissa erythrorhyncha 662800 Urocissa erythrorhyncha Pyrrhocorax pyrrhocorax 662798 Pyrrhocorax pyrrhocorax Dendrocitta vagabunda 197505 Dendrocitta vagabunda Lanius schach 304535 Lanius schach Lanius cristatus 802894 Lanius cristatus Lanius bucephalus 92674 Lanius bucephalus Lanius vittatus 75988 Lanius vittatus Emberiza melanocephala 178468 Emberiza melanocephala Lanius collurio 489155 Lanius collurio Lanius tigrinus 666133 Lanius tigrinus Lanius excubitor 146937 Lanius excubitor Lanius minor 143572 Lanius minor Terpsiphone paradisi 72480 Terpsiphone paradisi Dicrurus macrocercus 943593 Dicrurus macrocercus Dicrurus caerulescens 554149 Dicrurus caerulescens Vireo flavifrons 289080 Vireo flavifrons Vireo solitarius 48934 Vireo solitarius Vireo gilvus 621717 Vireo gilvus Emberiza bruniceps 178473 Emberiza bruniceps Vireo olivaceus 604019 Vireo olivaceus Oriolus chinensis 1098618 Oriolus chinensis Oriolus kundoo 114674 Oriolus kundoo Oriolus xanthornus 583087 Oriolus xanthornus Pericrocotus divaricatus 207806 Pericrocotus divaricatus Pericrocotus cinnamomeus 207807 Pericrocotus cinnamomeus Coracina melanoptera 524119 Coracina melanoptera Tephrodornis pondicerianus 961529 Tephrodornis pondicerianus Aegithina tiphia 1054561 Aegithina tiphia Empidonax traillii 67288 Empidonax traillii Emberiza lathami 922666 Melophus lathami Empidonax alnorum 203084 Empidonax alnorum Empidonax flaviventris 1095264 Empidonax flaviventris Empidonax minimus 604018 Empidonax minimus Empidonax hammondii 146936 Empidonax hammondii Cnemotriccus fuscatus 1044511 Cnemotriccus fuscatus Knipolegus cyanirostris 311610 Knipolegus cyanirostris Tyrannus melancholicus 1068161 Tyrannus melancholicus Tyrannus savana 36409 Tyrannus savana Pitangus sulphuratus 375105 Pitangus sulphuratus Myiarchus ferox 105676 Myiarchus ferox Zonotrichia querula 265552 Zonotrichia querula Molothrus bonariensis 213451 Molothrus bonariensis Elaenia parvirostris 311607 Elaenia parvirostris Elaenia spectabilis 412035 Elaenia spectabilis Platyrinchus mystaceus 32470 Platyrinchus mystaceus Pachyramphus castaneus 1041306 Pachyramphus castaneus Cephalopterus penduliger 3598420 Cephalopterus penduliger Dysithamnus mentalis 134528 Dysithamnus mentalis Isleria hauxwelli 872132 Myrmotherula hauxwelli Thamnophilus doliatus 799168 Thamnophilus doliatus Pyriglena leucoptera 806153 Pyriglena leucoptera Sittasomus griseicapillus 729975 Sittasomus griseicapillus Molothrus ater 213450 Molothrus ater Lepidocolaptes angustirostris 729977 Lepidocolaptes angustirostris Psarisomus dalhousiae 895684 Psarisomus dalhousiae Quiscalus mexicanus 743411 Quiscalus mexicanus Quiscalus quiscula 283668 Quiscalus quiscula Agelaius phoeniceus 226605 Agelaius phoeniceus Icterus graduacauda 1077599 Icterus graduacauda Sturnella magna 489144 Sturnella magna Sturnella militaris 979985 Sturnella militaris Xanthocephalus xanthocephalus 364331 Xanthocephalus xanthocephalus Icteria virens 998133 Icteria virens Zonotrichia capensis 265551 Zonotrichia capensis Setophaga petechia 612066 Setophaga petechia Setophaga graciae 455853 Setophaga graciae Setophaga coronata 451168 Setophaga coronata Myioborus pictus 285205 Myioborus pictus Cardellina rubrifrons 1061912 Cardellina rubrifrons Myiothlypis leucoblephara 292918 Basileuterus leucoblepharus Geospiza fortis 589951 Geospiza fortis Geospiza fuliginosa 589956 Geospiza fuliginosa Geospiza magnirostris 589955 Geospiza magnirostris Geospiza conirostris 589953 Geospiza conirostris Junco hyemalis 989502 Junco hyemalis Geospiza scandens 589959 Geospiza scandens Camarhynchus psittacula 419363 Camarhynchus psittacula Cactospiza pallida 963505 Camarhynchus pallidus Camarhynchus parvulus 419367 Camarhynchus parvulus Camarhynchus pauper 422530 Camarhynchus pauper Platyspiza crassirostris 589943 Platyspiza crassirostris Geospiza difficlis 419376 Geospiza difficilis Certhidea olivacea 589949 Certhidea olivacea Tiaris canora 349675 Tiaris canora Coereba flaveola 419369 Coereba flaveola Junco phaeonotus 765405 Junco phaeonotus Oryzoborus maximiliani 20533 Oryzoborus maximiliani Sporophila americana 772198 Sporophila americana Sporophila nigricollis 349673 Sporophila nigricollis Sporophila caerulescens 650030 Sporophila caerulescens Sporophila leucoptera 128444 Sporophila leucoptera Sporophila lineola 817090 Sporophila lineola Dacnis cayana 90901 Dacnis cayana Saltator maximus 396683 Saltator maximus Saltator aurantiirostris 396689 Saltator aurantiirostris Saltator similis 547309 Saltator similis Junco insularis 4947621 Junco insularis Saltator coerulescens 283670 Saltator coerulescens Emberizoides herbicola 885148 Emberizoides herbicola Sicalis flaveola 853515 Sicalis flaveola Haplospiza unicolor 998130 Haplospiza unicolor Charitospiza eucosma 3599764 Charitospiza eucosma Schistochlamys melanopis 415519 Schistochlamys melanopis Schistochlamys ruficapillus 320948 Schistochlamys ruficapillus Stephanophorus diadematus 320946 Stephanophorus diadematus Paroaria coronata 301064 Paroaria coronata Neothraupis fasciata 365559 Neothraupis fasciata Junco vulcani 3597254 Junco vulcani Pipraeidea bonariensis 6154288 Pipraeidea bonariensis Tangara cayana 238925 Tangara cayana Tangara preciosa 320944 Tangara preciosa Thraupis palmarum 516965 Thraupis palmarum Thraupis sayaca 946076 Thraupis sayaca Porphyrospiza caerulescens 545032 Porphyrospiza caerulescens Coryphospingus cucullatus 325412 Coryphospingus cucullatus Coryphospingus pileatus 779206 Coryphospingus pileatus Tachyphonus rufus 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true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true 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