Wei J.
Tchabanenko S.
Yamamoto Y.
Leavitt S.
Li H.
Lumbsch H.T.
Mccune B.
Wei X.
Wei X., Mccune B., Lumbsch H.T., Li H., Leavitt S., Yamamoto Y., Tchabanenko S., & Wei J.
2016-11-03
PLoS ONE
Limitations of Species Delimitation Based on Phylogenetic Analyses: A Case Study in the Hypogymnia hypotrypa Group (Parmeliaceae, Ascomycota)
Wei X., Mccune B., Lumbsch H.T., Li H., Leavitt S., Yamamoto Y., Tchabanenko S., & Wei J. 2016. Limitations of Species Delimitation Based on Phylogenetic Analyses: A Case Study in the Hypogymnia hypotrypa Group (Parmeliaceae, Ascomycota). PLoS ONE, 11(11): e0163664.
pythonVersion
2.7.9
pythonImplementation
CPython
Ascomycetes
$1
^(\S*\s+\S*).*
false
^dc:contributor
^dc:creator
^dc:date
^dc:publisher
^dc:title
^dcterms:bibliographicCitation
^ot:comment
^prism:creationDate
^prism:doi
^prism:modificationDate
^prism:number
^prism:publicationDate
^prism:publicationName
^prism:section
^prism:volume
^skos:changeNote
^skos:historyNote
^tb:identifier.study
^tb:title.study
@label
^skos:historyNote
@label
Tl2282306
Tl2282309
Tl2282314
Tl2282315
Tl2282316
Tl2282317
Tl2282318
Tl2282319
Tl2282320
Tl2282321
Tl2282325
Tl2282328
Tl2282330
Tl2282333
Tl2282338
Tl2282339
Tl2282340
Tl2282342
Tl2282359
Tl2282362
Tl2282363
Tl2282366
Tl2282374
Tl2282375
Tl2282376
Tl2282377
Tl2282380
Tl2282381
Tl2282382
Tl2282383
Tl2282307
Tl2282323
Tl2282336
Tl2282345
Tl2282310
Tl2282311
Tl2282312
Tl2282313
Tl2282322
Tl2282324
Tl2282326
Tl2282329
Tl2282332
Tl2282334
Tl2282335
Tl2282343
Tl2282344
Tl2282347
Tl2282349
Tl2282351
Tl2282352
Tl2282354
Tl2282357
Tl2282358
Tl2282360
Tl2282364
Tl2282367
Tl2282368
Tl2282369
Tl2282370
Tl2282371
Tl2282372
Tl2282373
Tl2282378
Tl2282379
Tl2282384
Tl2282346
Tl2282353
Tl2282355
Tl2282361
Tl2282365
Tl2282385
^skos:historyNote
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:branchLengthTimeUnit
^ot:nodeLabelMode
^ot:nodeLabelTimeUnit
^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis
^tb:kind.tree
^tb:ntax.tree
^tb:quality.tree
^tb:type.tree
Walter1186
305904
Parmeliaceae
ot_1413
Wei X., Mccune B., Lumbsch H.T., Li H., Leavitt S., Yamamoto Y., Tchabanenko S., & Wei J. 2016. Limitations of Species Delimitation Based on Phylogenetic Analyses: A Case Study in the Hypogymnia hypotrypa Group (Parmeliaceae, Ascomycota). PLoS ONE, 11(11): e0163664.
2016
2016-05-10
10.1371/journal.pone.0163664
2016-11-03
11
2016
PLoS ONE
Study
11
Generated on Mon Jun 25 04:34:58 UTC 2018
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlDocumentWriter@4c313ee $Rev$
19270
Limitations of Species Delimitation Based on Phylogenetic Analyses: A Case Study in the Hypogymnia hypotrypa Group (Parmeliaceae, Ascomycota)
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlOTUWriter@31862eae $Rev$
Hypogymnia flavida No 2
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia pruinoidea No 69
5312723
Hypogymnia pruinoidea
Brodoa intestiniformis
733703
Brodoa intestiniformis
Hypogymnia flavida No 4
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 45
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 39
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 60
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 56
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia flavida No 12
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 27
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 21
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 13
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 30
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 15
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 19
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 6
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 62
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia pruinoidea No 71
5312723
Hypogymnia pruinoidea
Hypogymnia hypotrypa No 35
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia flavida No 11
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 41
804374
Hypogymnia hypotrypa
Pseudevernia furfuracea
959711
Pseudevernia furfuracea
Hypogymnia flavida No 23
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 40
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia flavida No 20
538333
Hypogymnia flavida
Letharia gracilis
5312756
Letharia gracilis
Hypogymnia hypotrypa No 59
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia flavida No 7
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 43
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 31
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia pruinoidea No 72
5312723
Hypogymnia pruinoidea
Pseudevernia consocians
893160
Pseudevernia consocians
Hypogymnia flavida No 16
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 25
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 18
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia diffractaica No 63
3769902
Hypogymnia diffractaica
Hypogymnia flavida No 10
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 32
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 36
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia pruinoidea No 70
5312723
Hypogymnia pruinoidea
Hypogymnia fragillima No 65
3769838
Hypogymnia fragillima
Hypogymnia hypotrypa No 50
804374
Hypogymnia hypotrypa
Letharia vulpina
307129
Letharia vulpina
Hypogymnia hypotrypa No 42
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia physodes No 68
583552
Hypogymnia physodes
Hypogymnia hypotrypa No 61
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 48
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia fragillima No 66
3769838
Hypogymnia fragillima
Hypogymnia hypotrypa No 47
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia fragillima No 67
3769838
Hypogymnia fragillima
Arctoparmelia centrifuga
210236
Arctoparmelia centrifuga
Hypogymnia hypotrypa No 54
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 33
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia flavida No 5
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 34
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia fragillima No 64
3769838
Hypogymnia fragillima
Hypogymnia flavida No 3
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 26
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 44
804374
Hypogymnia hypotrypa
HHypogymnia vittata No 74
253516
Hypogymnia vittata
Hypogymnia flavida No 9
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 52
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 51
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 49
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 58
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 46
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 53
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 55
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia flavida No 24
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 8
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 1
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 14
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 57
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia hypotrypa No 37
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia flavida No 22
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 28
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 29
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia flavida No 17
538333
Hypogymnia flavida
Hypogymnia hypotrypa No 38
804374
Hypogymnia hypotrypa
Hypogymnia vittata No 73
253516
Hypogymnia vittata
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlTreeBlockWriter@26ae9787 $Rev$
ot:changesCount
Maximum likelihood
Tn14024430
Tr95891_ROOT
false
Species Tree
80
Preferred Tree
Single
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true