Wei J. Tchabanenko S. Yamamoto Y. Leavitt S. Li H. Lumbsch H.T. Mccune B. Wei X. Wei X., Mccune B., Lumbsch H.T., Li H., Leavitt S., Yamamoto Y., Tchabanenko S., & Wei J. 2016-11-03 PLoS ONE Limitations of Species Delimitation Based on Phylogenetic Analyses: A Case Study in the Hypogymnia hypotrypa Group (Parmeliaceae, Ascomycota) Wei X., Mccune B., Lumbsch H.T., Li H., Leavitt S., Yamamoto Y., Tchabanenko S., & Wei J. 2016. Limitations of Species Delimitation Based on Phylogenetic Analyses: A Case Study in the Hypogymnia hypotrypa Group (Parmeliaceae, Ascomycota). PLoS ONE, 11(11): e0163664. pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython Ascomycetes $1 ^(\S*\s+\S*).* false ^dc:contributor ^dc:creator ^dc:date ^dc:publisher ^dc:title ^dcterms:bibliographicCitation ^ot:comment ^prism:creationDate ^prism:doi ^prism:modificationDate ^prism:number ^prism:publicationDate ^prism:publicationName ^prism:section ^prism:volume ^skos:changeNote ^skos:historyNote ^tb:identifier.study ^tb:title.study @label ^skos:historyNote @label Tl2282306 Tl2282309 Tl2282314 Tl2282315 Tl2282316 Tl2282317 Tl2282318 Tl2282319 Tl2282320 Tl2282321 Tl2282325 Tl2282328 Tl2282330 Tl2282333 Tl2282338 Tl2282339 Tl2282340 Tl2282342 Tl2282359 Tl2282362 Tl2282363 Tl2282366 Tl2282374 Tl2282375 Tl2282376 Tl2282377 Tl2282380 Tl2282381 Tl2282382 Tl2282383 Tl2282307 Tl2282323 Tl2282336 Tl2282345 Tl2282310 Tl2282311 Tl2282312 Tl2282313 Tl2282322 Tl2282324 Tl2282326 Tl2282329 Tl2282332 Tl2282334 Tl2282335 Tl2282343 Tl2282344 Tl2282347 Tl2282349 Tl2282351 Tl2282352 Tl2282354 Tl2282357 Tl2282358 Tl2282360 Tl2282364 Tl2282367 Tl2282368 Tl2282369 Tl2282370 Tl2282371 Tl2282372 Tl2282373 Tl2282378 Tl2282379 Tl2282384 Tl2282346 Tl2282353 Tl2282355 Tl2282361 Tl2282365 Tl2282385 ^skos:historyNote ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree Walter1186 305904 Parmeliaceae ot_1413 Wei X., Mccune B., Lumbsch H.T., Li H., Leavitt S., Yamamoto Y., Tchabanenko S., & Wei J. 2016. Limitations of Species Delimitation Based on Phylogenetic Analyses: A Case Study in the Hypogymnia hypotrypa Group (Parmeliaceae, Ascomycota). PLoS ONE, 11(11): e0163664. 2016 2016-05-10 10.1371/journal.pone.0163664 2016-11-03 11 2016 PLoS ONE Study 11 Generated on Mon Jun 25 04:34:58 UTC 2018 Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlDocumentWriter@4c313ee $Rev$ 19270 Limitations of Species Delimitation Based on Phylogenetic Analyses: A Case Study in the Hypogymnia hypotrypa Group (Parmeliaceae, Ascomycota) Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlOTUWriter@31862eae $Rev$ Hypogymnia flavida No 2 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia pruinoidea No 69 5312723 Hypogymnia pruinoidea Brodoa intestiniformis 733703 Brodoa intestiniformis Hypogymnia flavida No 4 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 45 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 39 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 60 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 56 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia flavida No 12 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 27 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 21 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 13 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 30 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 15 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 19 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 6 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 62 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia pruinoidea No 71 5312723 Hypogymnia pruinoidea Hypogymnia hypotrypa No 35 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia flavida No 11 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 41 804374 Hypogymnia hypotrypa Pseudevernia furfuracea 959711 Pseudevernia furfuracea Hypogymnia flavida No 23 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 40 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia flavida No 20 538333 Hypogymnia flavida Letharia gracilis 5312756 Letharia gracilis Hypogymnia hypotrypa No 59 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia flavida No 7 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 43 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 31 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia pruinoidea No 72 5312723 Hypogymnia pruinoidea Pseudevernia consocians 893160 Pseudevernia consocians Hypogymnia flavida No 16 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 25 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 18 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia diffractaica No 63 3769902 Hypogymnia diffractaica Hypogymnia flavida No 10 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 32 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 36 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia pruinoidea No 70 5312723 Hypogymnia pruinoidea Hypogymnia fragillima No 65 3769838 Hypogymnia fragillima Hypogymnia hypotrypa No 50 804374 Hypogymnia hypotrypa Letharia vulpina 307129 Letharia vulpina Hypogymnia hypotrypa No 42 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia physodes No 68 583552 Hypogymnia physodes Hypogymnia hypotrypa No 61 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 48 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia fragillima No 66 3769838 Hypogymnia fragillima Hypogymnia hypotrypa No 47 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia fragillima No 67 3769838 Hypogymnia fragillima Arctoparmelia centrifuga 210236 Arctoparmelia centrifuga Hypogymnia hypotrypa No 54 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 33 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia flavida No 5 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 34 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia fragillima No 64 3769838 Hypogymnia fragillima Hypogymnia flavida No 3 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 26 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 44 804374 Hypogymnia hypotrypa HHypogymnia vittata No 74 253516 Hypogymnia vittata Hypogymnia flavida No 9 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 52 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 51 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 49 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 58 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 46 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 53 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 55 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia flavida No 24 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 8 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 1 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 14 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 57 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia hypotrypa No 37 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia flavida No 22 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 28 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 29 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia flavida No 17 538333 Hypogymnia flavida Hypogymnia hypotrypa No 38 804374 Hypogymnia hypotrypa Hypogymnia vittata No 73 253516 Hypogymnia vittata Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlTreeBlockWriter@26ae9787 $Rev$ ot:changesCount Maximum likelihood Tn14024430 Tr95891_ROOT false Species Tree 80 Preferred Tree Single true true true false true false true false true false true true true true true false true false true false true false true false true true true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true true true false true false true false true true true true true true true true