Cantrill D.J. Ladiges P.Y. Forster P.I. Duretto M. Bayly M.J. Barrett R. Barrett R., Bayly M.J., Duretto M., Forster P.I., Ladiges P.Y., & Cantrill D.J. 2018-05-08 Australian Systematic Botany Phylogenetic analysis of Zieria (Rutaceae) in Australia and New Caledonia based on nuclear ribosomal DNA shows species polyphyly, divergent paralogues and incongruence with chloroplast DNA Barrett R., Bayly M.J., Duretto M., Forster P.I., Ladiges P.Y., & Cantrill D.J. 2018. Phylogenetic analysis of Zieria (Rutaceae) in Australia and New Caledonia based on nuclear ribosomal DNA shows species polyphyly, divergent paralogues and incongruence with chloroplast DNA. Australian Systematic Botany, 31: 16-47. pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython Rosids $1 ^(\S*\s+\S*).* false ^dc:contributor ^dc:creator ^dc:date ^dc:publisher ^dc:title ^dcterms:bibliographicCitation ^ot:comment ^prism:creationDate ^prism:doi ^prism:endingPage ^prism:modificationDate ^prism:pageRange ^prism:publicationDate ^prism:publicationName ^prism:section ^prism:startingPage ^prism:volume ^skos:changeNote ^skos:historyNote ^tb:identifier.study ^tb:title.study @label ^skos:historyNote @label Tl2868758 Tl2868791 Tl2868759 Tl2868766 Tl2868769 Tl2868777 Tl2868786 Tl2868787 Tl2868794 Tl2868799 Tl2868805 Tl2868813 Tl2868814 Tl2868815 Tl2868817 Tl2868820 Tl2868822 Tl2868823 Tl2868830 Tl2868834 Tl2868849 Tl2868850 Tl2868852 Tl2868760 Tl2868803 Tl2868762 Tl2868765 Tl2868774 Tl2868776 Tl2868780 Tl2868819 Tl2868832 Tl2868847 Tl2868763 Tl2868860 Tl2868767 Tl2868768 Tl2868800 Tl2868848 Tl2868771 Tl2868851 Tl2868772 Tl2868808 Tl2868838 Tl2868775 Tl2868821 Tl2868778 Tl2868863 Tl2868781 Tl2868855 Tl2868785 Tl2868845 Tl2868788 Tl2868802 Tl2868789 Tl2868824 Tl2868790 Tl2868809 Tl2868829 Tl2868793 Tl2868825 Tl2868797 Tl2868864 Tl2868801 Tl2868835 Tl2868841 Tl2868810 Tl2868866 Tl2868826 Tl2868854 Tl2868831 Tl2868857 Tl2868836 Tl2868858 Tl2868840 Tl2868842 Tl2868856 Tl2868867 ^skos:historyNote ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree Walter1186 829308 Zieria ot_1433 Barrett R., Bayly M.J., Duretto M., Forster P.I., Ladiges P.Y., & Cantrill D.J. 2018. Phylogenetic analysis of Zieria (Rutaceae) in Australia and New Caledonia based on nuclear ribosomal DNA shows species polyphyly, divergent paralogues and incongruence with chloroplast DNA. Australian Systematic Botany, 31: 16-47. 2018 nrDNA 2017-08-25 10.1071/SB16034 47 2018-05-08 16-47 2018 Australian Systematic Botany Study 16 31 Generated on Thu Jun 28 23:51:45 UTC 2018 Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlDocumentWriter@79cc5ce4 $Rev$ 21451 Phylogenetic analysis of Zieria (Rutaceae) in Australia and New Caledonia based on nuclear ribosomal DNA shows species polyphyly, divergent paralogues and incongruence with chloroplast DNA Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlOTUWriter@8b607fb $Rev$ Zieria graniticola MTM479 5747599 Zieria graniticola Zieria whitei AF5486 5747585 Zieria whitei Zieria laevigata MTM258 879924 Zieria laevigata Zieria smithii DJO327 404874 Zieria smithii Zieria cytisoides AF5451 355093 Zieria cytisoides Zieria adenophora MJB2010 829304 Zieria adenophora Zieria arborescens DJO110 829302 Zieria arborescens Zieria distans MTM287 5747582 Zieria distans Zieria vagans PIF34832 5747604 Zieria vagans Zieria arborescens RAB512a 829302 Zieria arborescens Zieria smithii RAB511 404874 Zieria smithii Zieria oreocena RAB581 5747594 Zieria oreocena Zieria oreocena RAB580a 5747594 Zieria oreocena Zieria smithii MTM926 404874 Zieria smithii Zieria aspalathoides Bean27984 829288 Zieria aspalathoides Zieria ingramii IRT613 879926 Zieria ingramii Zieria minutiflora trichocarpa KRM8283 879934 Zieria minutiflora Neobyrnesia suberosa 829294 Neobyrnesia suberosa Zieria arborescens MFD2035 829302 Zieria arborescens Zieria caducibracteata IRT9585 355085 Zieria caducibracteata Zieria arborescens glabrifolia MTM213 829302 Zieria arborescens Zieria smithii PIF38466 404874 Zieria smithii Zieria baeuerlenii MJB2011 829286 Zieria baeuerlenii Zieria tenuis Bean4609 5747591 Zieria tenuis Zieria arborescens RAB504 829302 Zieria arborescens Zieria involucrata 506074 5747584 Zieria involucrata Zieria parrisiae RJ1899 879940 Zieria parrisiae Zieria bifida MTM537 5747592 Zieria bifida Zieria boolbunda KMS616 5747602 Zieria boolbunda Zieria littoralis MJB2017 879928 Zieria littoralis Zieria smithii PIF38231 404874 Zieria smithii Zieria smithii MTM275 404874 Zieria smithii Zieria odorifera 2706 2678 879942 Zieria odorifera Zieria collina MTM507 355081 Zieria collina Zieria prostrata 2701 2667 404870 Zieria prostrata Zieria laevigata PIF34475 879924 Zieria laevigata Zieria madida AF5320 5233157 Zieria madida Zieria pilosa MD2008 404868 Zieria pilosa Zieria smithii PIF34139 404874 Zieria smithii Zieria obcordata RJC106 879936 Zieria obcordata Zieria covenyi MJB2013 355091 Zieria covenyi Zieria insularis 2656 2681 5747601 Zieria insularis Zieria southwellii MTM251 404876 Zieria southwellii Zieria smithii MTM303 404874 Zieria smithii Zieria oreocena MJB1982 5747594 Zieria oreocena Zieria furfuracea euthadenia MTM280 355096 Zieria furfuracea Zieria odorifera 2705 2679 879942 Zieria odorifera Zieria cytisoides DJO416 355093 Zieria cytisoides Zieria buxijugum RJ1897 355083 Zieria buxijugum Zieria smithii MJB2184 404874 Zieria smithii Zieria granulata MJB2016 355098 Zieria granulata Zieria alata KM629212 5747583 Zieria alata Zieria minutiflora minutiflora ABP2356 879934 Zieria minutiflora Zieria prostrata 2714 2668 404870 Zieria prostrata Zieria lasiocaulisPG7908 5747595 Zieria lasiocaulis Zieria rimulosa JRC8002 5747581 Zieria rimulosa Zieria citriodora NGW2038 355079 Zieria citriodora Zieria smithii RAB548 404874 Zieria smithii Zieria smithii SPP2032 404874 Zieria smithii Zieria smithii PIF38266 404874 Zieria smithii Zieria tuberculata RAB505 404878 Zieria tuberculata Zieria smithii PIF33151 404874 Zieria smithii Zieria montana PIF36219 879932 Zieria montana Zieria arborescens MJB1868 829302 Zieria arborescens Zieria smithii PIF36221 404874 Zieria smithii Zieria caducibracteata 745482 355085 Zieria caducibracteata Zieria smithii MTM1127 404874 Zieria smithii Zieria smithii KRM8282 404874 Zieria smithii Zieria collina MJB2012 355081 Zieria collina Zieria pilosa RAB502 404868 Zieria pilosa Zieria veronicea veronicea MJB1980 5747600 Zieria veronicea Zieria laxiflora MTM385 879930 Zieria laxiflora Zieria compacta PIF34479 5747590 Zieria compacta Zieria prostrata 758677 404870 Zieria prostrata Zieria smithii MTM929 404874 Zieria smithii Zieria murphyi JA1356 879938 Zieria murphyi Zieria arborescens MBT270 829302 Zieria arborescens Zieria inexpectata CMH201 5747586 Zieria inexpectata Zieria smithii MJB2023 404874 Zieria smithii Zieria furfuracea furfuracea 466549 355096 Zieria furfuracea Zieria robusta MFD2049 404872 Zieria robusta Zieria chevalieri MJB2119 5233158 Zieria chevalieri Zieria minutiflora minutiflora PIF34313 879934 Zieria minutiflora Zieria robertsiorum AF5349 5747588 Zieria robertsiorum Zieria fraseri robusta MTB3739 355089 Zieria fraseri Zieria furfuracea gymnocarpa PIF34232 355096 Zieria furfuracea Zieria fraseri fraseri SPP1995 355089 Zieria fraseri Zieria formosa MJB2014 355087 Zieria formosa Zieria cephalophila TH339 5747603 Zieria cephalophila Zieria littoralis RAB508 879928 Zieria littoralis Zieria hindii 413359 5747589 Zieria hindii Zieria arborescens MJB2251a 829302 Zieria arborescens Zieria oreocena DJO222 5747594 Zieria oreocena Zieria smithii MJB2029 404874 Zieria smithii Zieria smithii PIF38276 404874 Zieria smithii Zieria ingramii 759202 879926 Zieria ingramii Zieria smithii AF5659 404874 Zieria smithii Zieria eungellaensis Bean4435 5747587 Zieria eungellaensis Zieria veronicea insularis WN14AE 5747600 Zieria veronicea Zieria involucrata LMD143 5747584 Zieria involucrata Zieria exsul 2659 2691 5747593 Zieria exsul Zieria murphyi 440349 879938 Zieria murphyi Zieria robusta DEA s.n. 404872 Zieria robusta Zieria obovata KRM8071 5747597 Zieria obovata Zieria distans CMH157 5747582 Zieria distans Zieria scopulus SPP1980 5747596 Zieria scopulus Zieria hydroscopica PIF38247 5747605 Zieria hydroscopica Zieria baeuerlenii 275527 829286 Zieria baeuerlenii Zieria insularis 2653 2682 5747601 Zieria insularis Zieria adenodonta MTM764 829306 Zieria adenodonta Zieria lasiocaulis 492944 5747595 Zieria lasiocaulis Zieria exsul 2661 2698 5747593 Zieria exsul Zieria verrucosa PIF34734 404880 Zieria verrucosa Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlTreeBlockWriter@4a7af46b $Rev$ ot:undefined Bayesian inference Tn16661331 Tr106414_ROOT false Species Tree 113 Unrated Consensus true true true true true true true true true true true true false true false true false true true true false true false true false true true true true false true true true true true true true true false true false true true true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true true true true false true true true true false true true true true false true false true false true false true false true false true true true true true true false true false true false true true true true true true true false true true true true true true true false true true true true true true false true false true true true true true true true false true true true false true false true false true false true false true false true true true false true true false true false true false true true true false true true true false true true true false true true true false true true false true true false true true true false true true true false true true ot:changesCount Bayesian inference Tn16661469 Tr106415_ROOT false Species Tree 113 Unrated Consensus true true true true true false true true true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true false true true true true true true true true true false true false true false true false true true true false true false true false true true true true false true true true true true true false true true true true true true true false true false true true true true true false true false true false true false true false true false true true true true false true true false true false true true true true true false true true true true true true false true true true true true true true false true false true true true true true true true false true true true false true false true false true false true false true false true true true false true true false true false true false true true true false true true true false true true true false true true true false true true true true true true true true true false true true true false true