Bibi F. Bibi F. 2013-08-11 BMC Evolutionary Biology Neogene Phylogenetic systematics Bayesian analysis Ruminantia Fossil calibration A multi-calibrated mitochondrial phylogeny of extant Bovidae (Artiodactyla, Ruminantia) and the importance of the fossil record to systematics Bibi F. 2013. A multi-calibrated mitochondrial phylogeny of extant Bovidae (Artiodactyla, Ruminantia) and the importance of the fossil record to systematics. BMC Evolutionary Biology, . pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython ^dc:contributor ^dc:creator ^dc:date ^dc:publisher ^dc:subject ^dc:title ^dcterms:bibliographicCitation ^prism:creationDate ^prism:doi ^prism:modificationDate ^prism:publicationDate ^prism:publicationName ^prism:section ^skos:changeNote ^skos:historyNote ^tb:identifier.study ^tb:title.study @label ^skos:historyNote ^skos:prefLabel ^skos:prefLabel @label Tl1075005 Tl1075006 Tl1075007 Tl1075008 Tl1075009 Tl1075010 Tl1075011 Tl1075012 Tl1075013 Tl1075014 Tl1075015 Tl1075016 Tl1075017 Tl1075018 Tl1075019 Tl1075020 Tl1075021 Tl1075022 Tl1075023 Tl1075024 Tl1075025 Tl1075026 Tl1075027 Tl1075028 Tl1075029 Tl1075030 Tl1075031 Tl1075032 Tl1075033 Tl1075034 Tl1075035 Tl1075036 Tl1075037 Tl1075038 Tl1075039 Tl1075040 Tl1075041 Tl1075042 Tl1075043 Tl1075044 Tl1075045 Tl1075046 Tl1075047 Tl1075048 Tl1075049 Tl1075050 Tl1075051 Tl1075052 Tl1075053 Tl1075054 Tl1075055 Tl1075056 Tl1075057 Tl1075058 Tl1075059 Tl1075060 Tl1075061 Tl1075062 Tl1075063 Tl1075064 Tl1075065 Tl1075066 Tl1075067 Tl1075068 Tl1075069 Tl1075070 Tl1075071 Tl1075072 Tl1075073 Tl1075074 Tl1075075 Tl1075076 Tl1075077 Tl1075078 Tl1075079 Tl1075080 Tl1075081 Tl1075082 Tl1075083 Tl1075084 Tl1075085 Tl1075086 Tl1075087 Tl1075088 Tl1075089 Tl1075090 Tl1075091 Tl1075092 Tl1075093 Tl1075094 Tl1075095 Tl1075096 Tl1075097 Tl1075098 Tl1075099 Tl1075100 Tl1075101 Tl1075102 Tl1075103 Tl1075104 Tl1075105 Tl1075106 Tl1075107 Tl1075108 Tl1075109 Tl1075110 Tl1075111 Tl1075112 Tl1075113 Tl1075114 Tl1075115 Tl1075116 Tl1075117 Tl1075118 Tl1075119 Tl1075120 Tl1075121 Tl1075122 Tl1075123 Tl1075124 Tl1075125 Tl1075126 Tl1075127 Tl1075128 Tl1075129 Tl1075130 Tl1075131 ^skos:historyNote @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:ottId ^ot:branchLengthDescription ^ot:branchLengthMode ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:curatedType ^ot:inGroupClade ^ot:outGroupEdge ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree Brian O'Meara ot_1497 Bibi F. 2013. A multi-calibrated mitochondrial phylogeny of extant Bovidae (Artiodactyla, Ruminantia) and the importance of the fossil record to systematics. BMC Evolutionary Biology, . 2013 2013-04-10 10.1186/1471-2148-13-166 2013-08-11 2013 BMC Evolutionary Biology Study Generated on Wed Jul 11 21:11:06 UTC 2018 Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlDocumentWriter@28ac1dff $Rev$ 14132 A Multi-Calibrated Phylogeny of Extant Bovidae (Mammalia, Artiodactyla) Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlOTUWriter@5164c7ec $Rev$ Cephalophus ogilbyi Capra caucasica Muntiacus muntjak Muntiacus muntjak NC004563 Philantomba monticola Philantomba monticola 1 Addax nasomaculatus Oryx gazella Nanger soemmerringii Capra falconeri Capra falconeri FJ207525 Budorcas taxicolor Budorcas taxicolor FJ207524 Tragelaphus spekii Bubalus depressicornis Rupicapra pyrenaica Rupicapra pyrenaica FJ207539 Cervus elaphus Cervus elaphus NC007704 Tragelaphus strepsiceros Naemorhedus baileyi Bos taurus taurus Bos taurus taurus EU177832 Bison bonasus Cephalophus silvicultor Tetracerus quadricornis Eudorcas rufifrons Eudorcas rufifrons 2 Bos taurus indicus EU177868 Gazella leptoceros Pseudois nayaur Pseudois nayaur FJ207537 Hyemoschus aquaticus Tragelaphus derbianus Taurotragus derbianus Hippotragus equinus Cephalophus callipygus Cephalophus callipygus 1 Cephalophus jentinki Tragelaphus scriptus Tragelaphus scriptus 1 Gazella gazella erlangeri Cephalophus spadix Nanger dama Gazella bennettii Kobus ellipsiprymnus Antidorcas marsupialis Oreamnos americanus Oreamnos americanus FJ207535 Giraffa camelopardalis antiquorum Capra sibirica Capra sibirica FJ207529 Giraffa camelopardalis angolensis Giraffa camelopardalis angolensis NC012100 Alcelaphus buselaphus buselaphus Boselaphus tragocamelus Bos gaurus Odocoileus hemionus Oreotragus oreotragus Bubalus bubalis bubalis AF547270 Capra ibex Capra ibex FJ207526 Bison bison Cephalophus adersi Pantholops hodgsonii Pantholops hodgsonii NC007441 Kobus leche Oryx dammah Bubalus bubalis carabanesis Cephalophus leucogaster Naemorhedus griseus griseus FJ207532 Connochaetes taurinus Connochaetes taurinus 2 Litocranius walleri Madoqua kirkii Antilope cervicapra Raphicerus campestris Nanger granti Oryx beisa Tragelaphus scriptus Tragelaphus scriptus 2 Cephalophus natalensis Ourebia ourebi Alces alces Cephalophus callipygus Cephalophus callipygus 3 Eudorcas rufifrons Eudorcas rufifrons 1 Ammotragus lervia Ammotragus lervia FJ207522 Naemorhedus griseus evansi Nesotragus moschatus Cephalophus callipygus Cephalophus callipygus 2 Hippotragus niger Sylvicapra grimmia Capricornis milneedwardsii FJ207534 Hydropotes inermis Tragelaphus oryx Dorcatragus megalotis Bos javanicus birmanicus Alcelaphus buselaphus lichtensteinii Rupicapra rupicapra Rupicapra rupicapra FJ207538 Gazella subgutturosa subgutturosa Gazella cuvieri Pseudoryx nghetinhensis Capricornis crispus Capricornis crispus FJ207533 Okapia johnstoni Bos grunniens Bos grunniens NC006380 Ovis aries Ovis aries NC001941 Cephalophus rufilatus Axis axis Gazella dorcas osiris Tragelaphus scriptus Tragelaphus scriptus 3 Cephalophus dorsalis Saiga tatarica Damaliscus pygargus Damaliscus pygargus FJ207530 Capricornis swinhoei Capricornis swinhoei NC010640 Capricornis crispus swinhoei Gazella dorcas pelzelnii Gazella gazella gazella Connochaetes taurinus Connochaetes taurinus 1 Neotragus batesi Procapra gutturosa Arabitragus jayakari FJ207523 Hemitragus jemlahicus Hemitragus jemlahicus FJ207531 Ovibos moschatus Ovibos moschatus FJ207536 Connochaetes gnou Capra nubiana Capra nubiana FJ207527 Tragulus kanchil Capra pyrenaica Capra pyrenaica FJ207528 Antilocapra americana Syncerus caffer Redunca arundinum Gazella subgutturosa marica Philantomba maxwelli Madoqua saltiana Aepyceros melampus Tragelaphus imberbis Bos javanicus javanicus Oryx leucoryx Moschus moschiferus Cephalophus nigrifrons Gazella spekei Pelea capreolus Redunca fulvorufula Tragelaphus eurycerus Moschus berezovskii Moschus berezovskii NC012694 Tragelaphus angasii Capra hircus Philantomba monticola Philantomba monticola 2 Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlTreeBlockWriter@23b84df9 $Rev$ Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Consensus true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Consensus true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true Species Tree 127 Unrated Single true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true