Bradley shaffer H. Lovely G. Thomson R.C. Spinks P. Spinks P., Thomson R.C., Lovely G., & Bradley shaffer H. 2009-03-10 BMC Evolutionary Biology Assessing what is needed to resolve a molecular phylogeny: simulations and empirical data from Emydid turtles. Spinks P., Thomson R.C., Lovely G., & Bradley shaffer H. 2009. Assessing what is needed to resolve a molecular phylogeny: simulations and empirical data from Emydid turtles. BMC Evolutionary Biology, 9(56): 56. pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython Tetrapods $1 ^(\S*\s+\S*).* false ^dc:contributor ^dc:creator ^dc:date ^dc:publisher ^dc:title ^dcterms:bibliographicCitation ^ot:comment ^prism:creationDate ^prism:doi ^prism:modificationDate ^prism:number ^prism:publicationDate ^prism:publicationName ^prism:section ^prism:volume ^skos:changeNote ^skos:historyNote ^tb:identifier.study ^tb:identifier.study.tb1 @label ^skos:historyNote ^skos:prefLabel ^skos:prefLabel ^skos:prefLabel ^skos:prefLabel ^skos:prefLabel ^ot:ottId ^skos:prefLabel ^skos:prefLabel @label Tl256254 Tl256280 Tl256315 Tl256316 Tl256255 Tl256267 Tl256273 Tl256301 Tl256256 Tl256297 Tl256257 Tl256259 Tl256312 Tl256258 Tl256264 Tl256296 Tl256260 Tl256281 Tl256282 Tl256261 Tl256268 Tl256313 Tl256262 Tl256291 Tl256305 Tl256307 Tl256263 Tl256298 Tl256265 Tl256308 Tl256266 Tl256271 Tl256303 Tl256269 Tl256276 Tl256285 Tl256270 Tl256284 Tl256290 Tl256299 Tl256272 Tl256311 Tl256274 Tl256283 Tl256314 Tl256275 Tl256306 Tl256278 Tl256287 Tl256279 Tl256302 Tl256289 Tl256294 Tl256310 Tl256293 Tl256300 Tl256295 Tl256309 ^skos:historyNote ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree Kaitlin Allen 587319 Emydidae ot_1524 Spinks P., Thomson R.C., Lovely G., & Bradley shaffer H. 2009. Assessing what is needed to resolve a molecular phylogeny: simulations and empirical data from Emydid turtles. BMC Evolutionary Biology, 9(56): 56. 2009 2009-03-10 10.1186/1471-2148-9-56 2009-03-10 56 2009 BMC Evolutionary Biology Study 9 Generated on Mon Jul 23 01:23:20 UTC 2018 Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlDocumentWriter@614cdd7f $Rev$ 9967 S2303 Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlOTUWriter@41bb539 $Rev$ Malaclemys terrapin 1064070 Malaclemys terrapin Heosemys spinosa 619859 Heosemys spinosa Pseudemys concinna 1003485 Pseudemys concinna Psammobates pardalis 776504 Stigmochelys pardalis Chelonia mydas 559133 Chelonia mydas Pseudemys nelsoni 526264 Pseudemys nelsoni Platysternon megacephalum 619860 Platysternon megacephalum Terrapene carolina 1 848786 Terrapene carolina Emys marmorata 4 743507 Actinemys marmorata Actinemys marmorata Graptemys geographica 2 1064023 Graptemys geographica Terrapene ornata leuteola 1013359 Terrapene ornata Glyptemys insculpta 2 743503 Glyptemys insculpta Terrapene ornata 1 1013359 Terrapene ornata Clemmys guttata 3 436621 Clemmys guttata Emys blandingii 1 1013355 Emydoidea blandingii Emydoidea blandingii Chrysemys picta 2 587300 Chrysemys picta Mauremys mutica 1 679467 Mauremys mutica Glyptemys insculpta 3 743503 Glyptemys insculpta Trachemys stejnegeri 1 608016 Trachemys stejnegeri Trachemys taylori 1 455436 Trachemys taylori Emys marmorata 3 743507 Actinemys marmorata Actinemys marmorata Emys blandingii 2 1013355 Emydoidea blandingii Emydoidea blandingii Glyptemys muhlenbergii 1 743501 Glyptemys muhlenbergii Emys orbicularis 3 733093 Emys orbicularis Trachemys taylori 2 455436 Trachemys taylori Pseudemys concinna floridana 1 448198 Pseudemys floridana Emys marmorata 2 743507 Actinemys marmorata Actinemys marmorata Terrapene coahuila 2 444150 Terrapene coahuila Trachemys scripta elegans 2 735228 Trachemys scripta elegans Glyptemys muhlenbergii 2 743501 Glyptemys muhlenbergii Trachemys scripta scripta 1 34957 Trachemys scripta scripta Graptemys caglei 2 515020 Graptemys caglei Emys trinacris 1 592138 Emys trinacris Terrapene carolina 4 848786 Terrapene carolina Clemmys guttata 1 436621 Clemmys guttata Clemmys guttata 2 436621 Clemmys guttata Terrapene coahuila 1 444150 Terrapene coahuila Emys orbicularis 2 733093 Emys orbicularis Glyptemys muhlenbergii 3 743501 Glyptemys muhlenbergii Terrapene carolina triunguis 2 256160 Terrapene mexicana triunguis Graptemys caglei 1 515020 Graptemys caglei Graptemys ouachatensis 480212 Graptemys ouachitensis Graptemys pseudogeographica 2 1092200 Graptemys pseudogeographica Emys orbicularis 4 733093 Emys orbicularis Chrysemys picta 1 587300 Chrysemys picta Terrapene carolina triunguis Terrapene carolina triunguis 1 Pseudemys peninsularis 2 351865 Pseudemys peninsularis Graptemys pseudogeographica 1 1092200 Graptemys pseudogeographica Deirochelys reticularia 1 848781 Deirochelys reticularia Glyptemys insculpta 1 743503 Glyptemys insculpta Graptemys geographica 1 1064023 Graptemys geographica Mauremys mutica 3 679467 Mauremys mutica Emys orbicularis 1 733093 Emys orbicularis Pseudemys peninsularis 1 351865 Pseudemys peninsularis Emys marmorata 1 743507 Actinemys marmorata Actinemys marmorata Emys trinacris 2 592138 Emys trinacris Trachemys taylori 3 455436 Trachemys taylori Trachemys scripta scripta 2 725741 Trachemys scripta Chrysemys picta 3 587300 Chrysemys picta Trachemys scripta elegans 1 735228 Trachemys scripta elegans Chrysemys picta 4 587300 Chrysemys picta Trachemys stejnegeri 2 608016 Trachemys stejnegeri Deirochelys reticularia 2 848781 Deirochelys reticularia Graptemys pseudogeographica 3 1092200 Graptemys pseudogeographica Pseudemys concinna floridana 2 448198 Pseudemys floridana Terrapene ornata 2 1013359 Terrapene ornata Emys blandingii 3 1013355 Emydoidea blandingii Emydoidea blandingii Terrapene coahuila 3 444150 Terrapene coahuila Terrapene carolina 3 848786 Terrapene carolina Terrapene carolina 2 848786 Terrapene carolina Trachemys s scripta 2 725741 Trachemys scripta Trachemys s scripta 1 34957 Trachemys scripta scripta Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlTreeBlockWriter@581864e3 $Rev$ ot:undefined Maximum likelihood Tn470429 Tr6135_ROOT false Species Tree 70 Unrated Single true true false true false true true true false true false true true true true true false true false true true false true true true false true true true true true true true false true true true false true true true false true true true true false true false true false true true true true true true true false true false true false true true true false true false true true true false true false true true true false true true true false true false true false true false true true true false true false true true true false true false true true true false true true true false true false true true true false true false true true true false true true true true false true true ot:undefined Maximum likelihood Tn527133 Tr6600_ROOT false Species Tree 66 Unrated Single true true true true true false true true false true false true true true false true true true true false true false true true true true true false true true true false true true true false true true true true true false true false true true true false true true true true false true false true true true false true false true false true true true false true false true true true false true true true false true true true false true false true false true false true true true false true true true false true false true false true true true false true false true true true false true false true true true false true true true false true