Bradley shaffer H.
Lovely G.
Thomson R.C.
Spinks P.
Spinks P., Thomson R.C., Lovely G., & Bradley shaffer H.
2009-03-10
BMC Evolutionary Biology
Assessing what is needed to resolve a molecular phylogeny: simulations and empirical data from Emydid turtles.
Spinks P., Thomson R.C., Lovely G., & Bradley shaffer H. 2009. Assessing what is needed to resolve a molecular phylogeny: simulations and empirical data from Emydid turtles. BMC Evolutionary Biology, 9(56): 56.
pythonVersion
2.7.9
pythonImplementation
CPython
Tetrapods
$1
^(\S*\s+\S*).*
false
^dc:contributor
^dc:creator
^dc:date
^dc:publisher
^dc:title
^dcterms:bibliographicCitation
^ot:comment
^prism:creationDate
^prism:doi
^prism:modificationDate
^prism:number
^prism:publicationDate
^prism:publicationName
^prism:section
^prism:volume
^skos:changeNote
^skos:historyNote
^tb:identifier.study
^tb:identifier.study.tb1
@label
^skos:historyNote
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^ot:ottId
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
@label
Tl256254
Tl256280
Tl256315
Tl256316
Tl256255
Tl256267
Tl256273
Tl256301
Tl256256
Tl256297
Tl256257
Tl256259
Tl256312
Tl256258
Tl256264
Tl256296
Tl256260
Tl256281
Tl256282
Tl256261
Tl256268
Tl256313
Tl256262
Tl256291
Tl256305
Tl256307
Tl256263
Tl256298
Tl256265
Tl256308
Tl256266
Tl256271
Tl256303
Tl256269
Tl256276
Tl256285
Tl256270
Tl256284
Tl256290
Tl256299
Tl256272
Tl256311
Tl256274
Tl256283
Tl256314
Tl256275
Tl256306
Tl256278
Tl256287
Tl256279
Tl256302
Tl256289
Tl256294
Tl256310
Tl256293
Tl256300
Tl256295
Tl256309
^skos:historyNote
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:branchLengthTimeUnit
^ot:nodeLabelMode
^ot:nodeLabelTimeUnit
^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis
^tb:kind.tree
^tb:ntax.tree
^tb:quality.tree
^tb:type.tree
^ot:branchLengthTimeUnit
^ot:nodeLabelMode
^ot:nodeLabelTimeUnit
^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis
^tb:kind.tree
^tb:ntax.tree
^tb:quality.tree
^tb:type.tree
Kaitlin Allen
587319
Emydidae
ot_1524
Spinks P., Thomson R.C., Lovely G., & Bradley shaffer H. 2009. Assessing what is needed to resolve a molecular phylogeny: simulations and empirical data from Emydid turtles. BMC Evolutionary Biology, 9(56): 56.
2009
2009-03-10
10.1186/1471-2148-9-56
2009-03-10
56
2009
BMC Evolutionary Biology
Study
9
Generated on Mon Jul 23 01:23:20 UTC 2018
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlDocumentWriter@614cdd7f $Rev$
9967
S2303
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlOTUWriter@41bb539 $Rev$
Malaclemys terrapin
1064070
Malaclemys terrapin
Heosemys spinosa
619859
Heosemys spinosa
Pseudemys concinna
1003485
Pseudemys concinna
Psammobates pardalis
776504
Stigmochelys pardalis
Chelonia mydas
559133
Chelonia mydas
Pseudemys nelsoni
526264
Pseudemys nelsoni
Platysternon megacephalum
619860
Platysternon megacephalum
Terrapene carolina 1
848786
Terrapene carolina
Emys marmorata 4
743507
Actinemys marmorata
Actinemys marmorata
Graptemys geographica 2
1064023
Graptemys geographica
Terrapene ornata leuteola
1013359
Terrapene ornata
Glyptemys insculpta 2
743503
Glyptemys insculpta
Terrapene ornata 1
1013359
Terrapene ornata
Clemmys guttata 3
436621
Clemmys guttata
Emys blandingii 1
1013355
Emydoidea blandingii
Emydoidea blandingii
Chrysemys picta 2
587300
Chrysemys picta
Mauremys mutica 1
679467
Mauremys mutica
Glyptemys insculpta 3
743503
Glyptemys insculpta
Trachemys stejnegeri 1
608016
Trachemys stejnegeri
Trachemys taylori 1
455436
Trachemys taylori
Emys marmorata 3
743507
Actinemys marmorata
Actinemys marmorata
Emys blandingii 2
1013355
Emydoidea blandingii
Emydoidea blandingii
Glyptemys muhlenbergii 1
743501
Glyptemys muhlenbergii
Emys orbicularis 3
733093
Emys orbicularis
Trachemys taylori 2
455436
Trachemys taylori
Pseudemys concinna floridana 1
448198
Pseudemys floridana
Emys marmorata 2
743507
Actinemys marmorata
Actinemys marmorata
Terrapene coahuila 2
444150
Terrapene coahuila
Trachemys scripta elegans 2
735228
Trachemys scripta elegans
Glyptemys muhlenbergii 2
743501
Glyptemys muhlenbergii
Trachemys scripta scripta 1
34957
Trachemys scripta scripta
Graptemys caglei 2
515020
Graptemys caglei
Emys trinacris 1
592138
Emys trinacris
Terrapene carolina 4
848786
Terrapene carolina
Clemmys guttata 1
436621
Clemmys guttata
Clemmys guttata 2
436621
Clemmys guttata
Terrapene coahuila 1
444150
Terrapene coahuila
Emys orbicularis 2
733093
Emys orbicularis
Glyptemys muhlenbergii 3
743501
Glyptemys muhlenbergii
Terrapene carolina triunguis 2
256160
Terrapene mexicana triunguis
Graptemys caglei 1
515020
Graptemys caglei
Graptemys ouachatensis
480212
Graptemys ouachitensis
Graptemys pseudogeographica 2
1092200
Graptemys pseudogeographica
Emys orbicularis 4
733093
Emys orbicularis
Chrysemys picta 1
587300
Chrysemys picta
Terrapene carolina triunguis
Terrapene carolina triunguis 1
Pseudemys peninsularis 2
351865
Pseudemys peninsularis
Graptemys pseudogeographica 1
1092200
Graptemys pseudogeographica
Deirochelys reticularia 1
848781
Deirochelys reticularia
Glyptemys insculpta 1
743503
Glyptemys insculpta
Graptemys geographica 1
1064023
Graptemys geographica
Mauremys mutica 3
679467
Mauremys mutica
Emys orbicularis 1
733093
Emys orbicularis
Pseudemys peninsularis 1
351865
Pseudemys peninsularis
Emys marmorata 1
743507
Actinemys marmorata
Actinemys marmorata
Emys trinacris 2
592138
Emys trinacris
Trachemys taylori 3
455436
Trachemys taylori
Trachemys scripta scripta 2
725741
Trachemys scripta
Chrysemys picta 3
587300
Chrysemys picta
Trachemys scripta elegans 1
735228
Trachemys scripta elegans
Chrysemys picta 4
587300
Chrysemys picta
Trachemys stejnegeri 2
608016
Trachemys stejnegeri
Deirochelys reticularia 2
848781
Deirochelys reticularia
Graptemys pseudogeographica 3
1092200
Graptemys pseudogeographica
Pseudemys concinna floridana 2
448198
Pseudemys floridana
Terrapene ornata 2
1013359
Terrapene ornata
Emys blandingii 3
1013355
Emydoidea blandingii
Emydoidea blandingii
Terrapene coahuila 3
444150
Terrapene coahuila
Terrapene carolina 3
848786
Terrapene carolina
Terrapene carolina 2
848786
Terrapene carolina
Trachemys s scripta 2
725741
Trachemys scripta
Trachemys s scripta 1
34957
Trachemys scripta scripta
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlTreeBlockWriter@581864e3 $Rev$
ot:undefined
Maximum likelihood
Tn470429
Tr6135_ROOT
false
Species Tree
70
Unrated
Single
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
true
true
false
true
false
true
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
false
true
false
true
false
true
true
true
true
true
true
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
false
true
true
ot:undefined
Maximum likelihood
Tn527133
Tr6600_ROOT
false
Species Tree
66
Unrated
Single
true
true
true
true
true
false
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
false
true
false
true
true
true
true
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true