Koji K. Suga H. Uzuhashi S. Coffey M.D. Uematsu S. Rahman M.Z. Rahman M.Z., Uematsu S., Coffey M.D., Uzuhashi S., Suga H., & Koji K. 2014-12-27 Mycoscience Homology • Identification • Intra-specific • Phylogeny • Variation・ Re-evaluation of Japanese Phytophthora isolates based on molecular phylogenetic analyses Rahman M.Z., Uematsu S., Coffey M.D., Uzuhashi S., Suga H., & Koji K. 2014. Re-evaluation of Japanese Phytophthora isolates based on molecular phylogenetic analyses. Mycoscience, 55(4): 314-327. pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython SAR group $1 ^(\S*\s+\S*).* false ^dc:contributor ^dc:creator ^dc:date ^dc:publisher ^dc:subject ^dc:title ^dcterms:bibliographicCitation ^ot:comment ^prism:creationDate ^prism:doi ^prism:endingPage ^prism:modificationDate ^prism:number ^prism:pageRange ^prism:publicationDate ^prism:publicationName ^prism:section ^prism:startingPage ^prism:volume ^skos:changeNote ^skos:historyNote ^tb:identifier.study ^tb:title.study @label ^skos:historyNote ^skos:prefLabel @label Tl957585 Tl957591 Tl957629 Tl957632 Tl957643 Tl957650 Tl957657 Tl957665 Tl957666 Tl957673 Tl957696 Tl957698 Tl957586 Tl957587 Tl957594 Tl957597 Tl957598 Tl957600 Tl957610 Tl957612 Tl957613 Tl957618 Tl957626 Tl957638 Tl957640 Tl957642 Tl957652 Tl957653 Tl957671 Tl957680 Tl957684 Tl957689 Tl957693 Tl957697 Tl957599 Tl957630 Tl957664 Tl957615 Tl957685 Tl957624 Tl957660 Tl957681 Tl957661 Tl957682 ^skos:historyNote @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label @label @label ^ot:isTaxonExemplar @label @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar @label @label ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis ^tb:kind.tree ^tb:ntax.tree ^tb:quality.tree ^tb:type.tree ^ot:ottId Kaitlin Allen 775740 Phytophthora ot_1550 Rahman M.Z., Uematsu S., Coffey M.D., Uzuhashi S., Suga H., & Koji K. 2014. Re-evaluation of Japanese Phytophthora isolates based on molecular phylogenetic analyses. Mycoscience, 55(4): 314-327. 2014 2012-12-10 10.1016/j.myc.2013.11.005 327 2014-12-27 4 314-327 2014 Mycoscience Study 314 55 Generated on Thu Jul 26 00:58:49 UTC 2018 Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlDocumentWriter@2e9f23a7 $Rev$ 13726 Re-evaluation of Japanese Phytophthora isolates based on molecular phylogenetic analyses Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlOTUWriter@7938cffb $Rev$ Phytophthora species Toku 1 Phytophthora megasperma MAFF237500 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora megasperma P A 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora humicola 88466 Phytophthora humicola Phytophthora tentaculata 662695 Phytophthora tentaculata Phytophthora heveae 5385443 Phytophthora heveae Phytophthora species MAFF235788 Phytophthora pini 1054670 Phytophthora pini Phytophthora cuyabensis 787225 Phytophthora cuyabensis Phytophthora megasperma CH95PHG8 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora cryptogea 775732 Phytophthora cryptogea Phytophthora europaea 605928 Phytophthora europaea Phytophthora megasperma NBRC31624 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora megasperma CH95PHR16 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora drechsleri CH96HE1 405025 Phytophthora drechsleri Phytophthora megasperma CH04PHR11 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora phaseoli 88502 Phytophthora phaseoli Phytophthora meadii 130119 Phytophthora meadii Phytophthora capsici 775738 Phytophthora capsici Phytophthora nemorosa 459224 Phytophthora nemorosa Phytophthora nicotianae 469192 Phytophthora nicotianae Phytophthora chrysanthemi 925922 Phytophthora chrysanthemi Phytophthora gonapodyides 23193 Phytophthora gonapodyides Phytophthora gregata 460101 Phytophthora gregata Phytophthora rubi 662691 Phytophthora rubi Phytophthora megasperma CH97PHR1 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora sansomeana 559368 Phytophthora sansomeana Phytophthora megasperma Pm 1 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora megasperma GF543 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora fragariae 152482 Phytophthora fragariae Phytophthora sojae 740156 Phytophthora sojae Phytophthora primulae 662694 Phytophthora primulae Phytophthora alni 909695 Phytophthora alni Phytophthora megasperma CH95PHR10 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora katsurae 88498 Phytophthora katsurae Phytophthora porri 88503 Phytophthora porri Phytophthora bisheria 466152 Phytophthora bisheria Phytophthora megakarya 252692 Phytophthora megakarya Phytophthora asparagi 610547 Phytophthora asparagi Phytophthora cactorum MAFF235099 710888 Phytophthora cactorum Phytophthora kernoviae 22095 Phytophthora kernoviae Phytophthora megasperma CH00MKR1 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora iranica 740155 Phytophthora iranica Phytophthora syringae 740158 Phytophthora syringae Phytophthora species kelmania Phytophthora drechsleri CH96HE2 405025 Phytophthora drechsleri Phytophthora cinnamomi 355178 Phytophthora cinnamomi Phytophthora species MAFF238158 Phytophthora multivesiculata 88501 Phytophthora multivesiculata Phytophthora captiosa 505188 Phytophthora captiosa Phytophthora ramorum 769955 Phytophthora ramorum Phytophthora mirabilis 88500 Phytophthora mirabilis Phytophthora glovera 129650 Phytophthora glovera Phytophthora megasperma CH95PHR17 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora quercina 23194 Phytophthora quercina Phytophthora megasperma CH95PHG7 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora botryosa 609883 Phytophthora botryosa Phytophthora megasperma CH02PHR1 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora species APC001 Phytophthora sinensis 662693 Phytophthora sinensis Phytophthora niederhauserii 27164 Phytophthora niederhauserii Phytophthora inflata 88468 Phytophthora inflata Phytophthora cambivora 152479 Phytophthora cambivora Phytophthora arecae 5385446 Phytophthora arecae Phytophthora citrophthora 252699 Phytophthora citrophthora Phytophthora species MAFF235794 Phytophthora clandestina 103293 Phytophthora clandestina Phytophthora megasperma 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora megasperma NBRC32176 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora boehmeriae 189661 Phytophthora boehmeriae Phytophthora pseudosyringae 114629 Phytophthora pseudosyringae Phytophthora polonica 212631 Phytophthora polonica Phytophthora species GF468 Phytophthora infestans 775725 Phytophthora infestans Phytophthora pistaciae 230520 Phytophthora pistaciae Phytophthora cactorum NBRC32194 710888 Phytophthora cactorum Phytophthora citricola 152480 Phytophthora citricola Phytophthora hibernalis 81905 Phytophthora hibernalis Phytophthora macrochlamydospora 740154 Phytophthora macrochlamydospora Phytophthora drechsleri 405025 Phytophthora drechsleri Phytophthora species MAFF239556 Phytophthora species GF534 Phytophthora vignae 740159 Phytophthora vignae Phytophthora idaei 152484 Phytophthora idaei Halophytophthora vesicula 437456 Halophytophthora vesicula Phytophthora richardiae 1070127 Phytophthora richardiae Phytophthora megasperma P B 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora erythroseptica 552580 Phytophthora erythroseptica Phytophthora cinnamomi parvispora Phytophthora cinnamomi var parvispora Phytophthora cinnamomi var. parvispora Phytophthora fallax 834837 Phytophthora fallax Phytophthora cajani 609882 Phytophthora cajani Phytophthora brassicae 359638 Phytophthora brassicae Phytophthora melonis 262028 Phytophthora melonis Phytophthora ipomoeae 36769 Phytophthora ipomoeae Phytophthora foliorum 480561 Phytophthora foliorum Phytophthora megasperma CH00MKR2 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora cactorum 710888 Phytophthora cactorum Phytophthora citricola CH97TUL2 152480 Phytophthora citricola Phytophthora quininea 715674 Phytophthora quininea Phytophthora megasperma CH04PHR12 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora sojae NBRC31016 740156 Phytophthora sojae Phytophthora siskiyouensis 325901 Phytophthora siskiyouensis Phytophthora colocasiae 88463 Phytophthora colocasiae Phytophthora medicaginis 856913 Phytophthora medicaginis Phytophthora megasperma GF433 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora hedraiandra 850408 Phytophthora hedraiandra Phytophthora palmivora 88464 Phytophthora palmivora Phytophthora pseudotsugae 152485 Phytophthora pseudotsugae Phytophthora megasperma GF649 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora ilicis 103294 Phytophthora ilicis Phytophthora mexicana 399694 Phytophthora mexicana Phytophthora species MAFF235786 Phytophthora megasperma CH94PHR1 775722 Phytophthora megasperma Phytophthora species MAFF235784 Phytophthora insolita 1070126 Phytophthora insolita Phytophthora inundata 572665 Phytophthora inundata Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlTreeBlockWriter@2b372cb $Rev$ ot:changesCount Neighbor-joining Tn9659791 Tr59565_ROOT false Species Tree 116 Unrated Consensus true true true true true true true true true true true true true true true true true true true false true true false true false true false true true true true true false true false true false true true false true false true false true false true false true false true true true false true false true false true false true false true true true true true true true true false true false true true true true true false true true true true true true false true false true true true true false true true true false true true true true true true false true true true true true false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true