pythonVersion 3.10.12 pythonImplementation CPython true Birds false Source data for tree(s) 'tree1' tree1 Source data for tree(s) 'tree2' tree2 @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label @label ^ot:comment highestMintedElementIDs ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:reasonsToExcludeFromSynthesis Emily Jane McTavish ot_2312 Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, AA. et al. Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes. Nature (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07323-1 2024 Callipepla squamata 728092 Callipepla squamata Penelope pileata 1024688 Penelope pileata Locustella ochotensis 326781 Locustella ochotensis Oxylabes madagascariensis 353520 Oxylabes madagascariensis Donacobius atricapilla 636360 Donacobius atricapilla Hirundo rustica 1040135 Hirundo rustica Phylloscopus trochilus 96282 Phylloscopus trochilus Rhadina sibilatrix 6153747 Phylloscopus sibillatrix Hylia prasina 3360 Hylia prasina Aegithalos caudatus 467867 Aegithalos caudatus Erythrocercus mccallii 72470 Erythrocercus mccallii Cettia cetti 1010418 Cettia cetti Alectura lathami 570956 Alectura lathami Horornis vulcanius 355463 Cettia vulcania Brachypodius atriceps 778855 Brachypodius atriceps Pycnonotus jocosus 778857 Pycnonotus jocosus Sinosuthora webbiana 802901 Paradoxornis webbianus Sylvia atricapilla 726312 Sylvia atricapilla Sylvia borin 261410 Sylvia borin Sterrhoptilus dennistouni 7068665 Sterrhoptilus dennistouni Zosterops hypoxanthus 3598281 Zosterops hypoxanthus Zosterops lateralis 819155 Zosterops lateralis Pomatorhinus ruficollis 154418 Pomatorhinus ruficollis Chauna torquata 860132 Chauna torquata Illadopsis cleaveri 1028018 Illadopsis cleaveri Leiothrix lutea 965458 Leiothrix lutea Drymodes brunneopygia 1061814 Drymodes brunneopygia Chaetops frenatus 360543 Chaetops frenatus Picathartes gymnocephalus 699623 Picathartes gymnocephalus Callaeas wilsoni 3597860 Callaeas wilsoni Notiomystis cincta 1097188 Notiomystis cincta Ptilorrhoa leucosticta 665634 Ptilorrhoa leucosticta Edolisoma coerulescens 883543 Coracina coerulescens Chaetorhynchus papuensis 310386 Chaetorhynchus papuensis Anseranas semipalmata 714464 Anseranas semipalmata Rhipidura dahli 871288 Rhipidura dahli Dicrurus megarhynchus 597537 Dicrurus megarhynchus Myiagra hebetior 346149 Myiagra hebetior Struthidea cinerea 520286 Struthidea cinerea Ifrita kowaldi 242575 Ifrita kowaldi Paradisaea raggiana 499638 Paradisaea raggiana Lanius ludovicianus 551815 Lanius ludovicianus Aphelocoma coerulescens 175629 Aphelocoma coerulescens Corvus moneduloides 200022 Corvus moneduloides Corvus brachyrhynchos 331952 Corvus brachyrhynchos Anser cygnoid 7659620 Anser cygnoid Corvus cornix 597020 Corvus cornix Mohoua ochrocephala 452017 Mohoua ochrocephala Machaerirhynchus nigripectus 523967 Machaerirhynchus nigripectus Gymnorhina tibicen 464854 Gymnorhina tibicen Rhagologus leucostigma 226273 Rhagologus leucostigma Dryoscopus gambensis 331949 Dryoscopus gambensis Dyaphorophyia castanea 471073 Dyaphorophyia castanea Mystacornis crossleyi 503738 Mystacornis crossleyi Daphoenositta chrysoptera 439404 Daphoenositta chrysoptera Eulacestoma nigropectus 663331 Eulacestoma nigropectus Cairina moschata 714469 Cairina moschata Aleadryas rufinucha 89244 Aleadryas rufinucha Falcunculus frontatus 965222 Falcunculus frontatus Pachycephala philippinensis 1001535 Pachycephala philippinensis Oriolus oriolus 299687 Oriolus oriolus Oreocharis arfaki 875031 Oreocharis arfaki Pteruthius melanotis 41271 Pteruthius melanotis Erpornis zantholeuca 602539 Erpornis zantholeuca Vireo altiloquus 48944 Vireo altiloquus Orthonyx spaldingii 488743 Orthonyx spaldingii Pomatostomus ruficeps 565804 Pomatostomus ruficeps Asarcornis scutulata 30843 Asarcornis scutulata Malurus elegans 827140 Malurus elegans Dasyornis broadbenti 196938 Dasyornis broadbenti Grantiella picta 527599 Grantiella picta Origma solitaria 827145 Origma solitaria Pardalotus punctatus 1066393 Pardalotus punctatus Climacteris rufus 531212 Climacteris rufus Ptilonorhynchus violaceus 187409 Ptilonorhynchus violaceus Atrichornis clamosus 1031586 Atrichornis clamosus Menura novaehollandiae 531206 Menura novaehollandiae Neodrepanis coruscans 540005 Neodrepanis coruscans Anas platyrhynchos 765167 Anas platyrhynchos Serilophus lunatus 768994 Serilophus lunatus Sapayoa aenigma 395861 Sapayoa aenigma Pitta sordida 44876 Pitta sordida Calyptomena viridis 26175 Calyptomena viridis Smithornis capensis 283120 Smithornis capensis Rhegmatorhina hoffmannsi 1092626 Rhegmatorhina hoffmannsi Sakesphorus luctuosus 394152 Sakesphorus luctuosus Grallaria varia 1091665 Grallaria varia Scytalopus superciliaris 840823 Scytalopus superciliaris Formicarius rufipectus 227774 Formicarius rufipectus Anas zonorhyncha 30850 Anas zonorhyncha Sclerurus mexicanus 806162 Sclerurus mexicanus Furnarius figulus 475744 Furnarius figulus Campylorhamphus procurvoides 12255 Campylorhamphus procurvoides Xiphorhynchus elegans 443016 Xiphorhynchus elegans Lepidothrix coronata 49248 Lepidothrix coronata Manacus manacus 129404 Manacus manacus Cephalopterus ornatus 860310 Cephalopterus ornatus Pachyramphus minor 835165 Pachyramphus minor Onychorhynchus coronatus 179648 Onychorhynchus coronatus Oxyruncus cristatus 931726 Oxyruncus cristatus Phoenicopterus ruber 443650 Phoenicopterus ruber Piprites chloris 456266 Piprites chloris Neopipo cinnamomea 636756 Neopipo cinnamomea Tachuris rubrigastra 187657 Tachuris rubrigastra Mionectes macconnelli 1015939 Mionectes macconnelli Tyrannus savana 36409 Tyrannus savana Nestor notabilis 749203 Nestor notabilis Eolophus roseicapillus 900913 Eolophus roseicapillus Probosciger aterrimus 645854 Probosciger aterrimus Amazona guildingii 1073065 Amazona guildingii Agapornis roseicollis 174401 Agapornis roseicollis Colinus virginianus 204709 Colinus virginianus Podiceps cristatus 92263 Podiceps cristatus Melopsittacus undulatus 734818 Melopsittacus undulatus Herpetotheres cachinnans 438655 Herpetotheres cachinnans Falco cherrug 1001807 Falco cherrug Falco peregrinus 786435 Falco peregrinus Cariama cristata 86685 Cariama cristata Chunga burmeisteri 3600042 Chunga burmeisteri Colius striatus 462544 Colius striatus Urocolius indicus 1094061 Urocolius indicus Leptosomus discolor 897867 Leptosomus discolor Apaloderma vittatum 291857 Apaloderma vittatum Podilymbus podiceps 962399 Podilymbus podiceps Trogon melanurus 1065612 Trogon melanurus Buceros rhinoceros 785189 Buceros rhinoceros Bucorvus abyssinicus 991309 Bucorvus abyssinicus Rhinopomastus cyanomelas 49610 Rhinopomastus cyanomelas Upupa epops 412129 Upupa epops Merops nubicus 989087 Merops nubicus Brachypteracias leptosomus 483805 Brachypteracias leptosomus Eurystomus gularis 704138 Eurystomus gularis Todus mexicanus 741575 Todus mexicanus Baryphthengus martii 88377 Baryphthengus martii Acanthisitta chloris 1085740 Acanthisitta chloris Ceyx cyanopectus 838161 Alcedo cyanopectus Chloroceryle aenea 986901 Chloroceryle aenea Halcyon senegalensis 234474 Halcyon senegalensis Bucco capensis 483807 Bucco capensis Galbula dea 721164 Galbula dea Picoides pubescens 873958 Picoides pubescens Indicator maculatus 552486 Indicator maculatus Psilopogon haemacephalus 738739 Megalaima haemacephala Tricholaema leucomelas 214987 Tricholaema leucomelas Eubucco bourcierii 815705 Eubucco bourcierii Cnemophilus loriae 310390 Cnemophilus loriae Ramphastos sulfuratus 1030674 Ramphastos sulfuratus Semnornis frantzii 542000 Semnornis frantzii Tyto alba 1065606 Tyto alba Glaucidium brasilianum 933120 Glaucidium brasilianum Ciccaba nigrolineata 125910 Ciccaba nigrolineata Strix occidentalis 273899 Strix occidentalis Cathartes aura 9106 Cathartes aura Sagittarius serpentarius 1036186 Sagittarius serpentarius Pandion haliaetus 509837 Pandion haliaetus Circaetus pectoralis 103125 Circaetus pectoralis Melanocharis versteri 1015949 Melanocharis versteri Haliaeetus albicilla 263118 Haliaeetus albicilla Haliaeetus leucocephalus 1012350 Haliaeetus leucocephalus Aquila chrysaetos 263127 Aquila chrysaetos Spizaetus tyrannus 806941 Spizaetus tyrannus Phaethon lepturus 855119 Phaethon lepturus Eurypyga helias 86680 Eurypyga helias Rhynochetos jubatus 86672 Rhynochetos jubatus Gavia stellata 1057044 Gavia stellata Aptenodytes forsteri 494370 Aptenodytes forsteri Pygoscelis adeliae 494357 Pygoscelis adeliae Promerops cafer 843515 Promerops cafer Thalassarche chlororhynchos 663145 Thalassarche chlororhynchos Fregetta grallaria 82197 Fregetta grallaria Oceanites oceanicus 656591 Oceanites oceanicus Hydrobates tethys 603905 Hydrobates tethys Fulmarus glacialis 1028832 Fulmarus glacialis Calonectris borealis 3595600 Calonectris borealis Pelecanoides urinatrix 904486 Pelecanoides urinatrix Ciconia maguari 324161 Ciconia maguari Mesembrinibis cayennensis 674305 Mesembrinibis cayennensis Nipponia nippon 946418 Nipponia nippon Dicaeum eximium 223166 Dicaeum eximium Cochlearius cochlearius 154815 Cochlearius cochlearius Egretta garzetta 273425 Egretta garzetta Balaeniceps rex 464697 Balaeniceps rex Pelecanus crispus 427900 Pelecanus crispus Scopus umbretta 464704 Scopus umbretta Fregata magnificens 330000 Fregata magnificens Sula dactylatra 170197 Sula dactylatra Anhinga anhinga 170196 Anhinga anhinga Anhinga rufa 986356 Anhinga rufa Phalacrocorax carbo 969841 Phalacrocorax carbo Leptocoma aspasia 7661432 Leptocoma aspasia Phalacrocorax pelagicus 744568 Urile pelagicus Phalacrocorax harrisi 409434 Nannopterum harrisi Phalacrocorax auritus 170200 Nannopterum auritus Phalacrocorax brasilianus 109023 Nannopterum brasilianus Nyctiprogne leucopyga 51270 Nyctiprogne leucopyga Antrostomus carolinensis 416426 Antrostomus carolinensis Chordeiles acutipennis 484902 Chordeiles acutipennis Steatornis caripensis 701548 Steatornis caripensis Nyctibius bracteatus 178250 Nyctibius bracteatus Nyctibius grandis 178249 Nyctibius grandis Chloropsis cyanopogon 608137 Chloropsis cyanopogon Podargus strigoides 313120 Podargus strigoides Aegotheles bennettii 540032 Aegotheles bennettii Chaetura pelagica 609785 Chaetura pelagica Hemiprocne comata 1077292 Hemiprocne comata Calypte anna 810756 Calypte anna Oreotrochilus melanogaster 62611 Oreotrochilus melanogaster Opisthocomus hoazin 928360 Opisthocomus hoazin Burhinus bistriatus 57829 Burhinus bistriatus Chionis minor 738515 Chionis minor Pluvianellus socialis 227451 Pluvianellus socialis Chloropsis hardwickii 797578 Chloropsis hardwickii Charadrius alexandrinus 112947 Charadrius alexandrinus Charadrius vociferus 661811 Charadrius vociferus Himantopus himantopus 364171 Himantopus himantopus Ibidorhyncha struthersii 651064 Ibidorhyncha struthersii Limosa lapponica 304018 Limosa lapponica Arenaria interpres 821753 Arenaria interpres Calidris pugnax 1090732 Calidris pugnax Pedionomus torquatus 163953 Pedionomus torquatus Thinocorus orbignyianus 628490 Thinocorus orbignyianus Jacana jacana 332005 Jacana jacana Odontophorus gujanensis 329457 Odontophorus gujanensis Irena cyanogastra 176452 Irena cyanogastra Nycticryphes semicollaris 953621 Nycticryphes semicollaris Rostratula benghalensis 5276 Rostratula benghalensis Turnix velox 3600478 Turnix velox Dromas ardeola 383929 Dromas ardeola Glareola pratincola 980449 Glareola pratincola Rhinoptilus africanus 57833 Rhinoptilus africanus Stercorarius parasiticus 742640 Stercorarius parasiticus Cepphus grylle 280901 Cepphus grylle Alca torda 855485 Alca torda Uria aalge 820016 Uria aalge Peucedramus taeniatus 370807 Peucedramus taeniatus Uria lomvia 551817 Uria lomvia Phaetusa simplex 341044 Phaetusa simplex Rynchops niger 738512 Rynchops niger Rissa tridactyla 585161 Rissa tridactyla Chroicocephalus maculipennis 698967 Chroicocephalus maculipennis Larus smithsonianus 526679 Larus smithsonianus Heliornis fulica 440618 Heliornis fulica Atlantisia rogersi 3599985 Atlantisia rogersi Zapornia atra 7659998 Zapornia atra Psophia crepitans 915643 Psophia crepitans Prunella fulvescens 795160 Prunella fulvescens Aramus guarauna 1095362 Aramus guarauna Balearica regulorum 191006 Balearica regulorum Grus americana 414356 Grus americana Mesitornis unicolor 966316 Mesitornis unicolor Pterocles burchelli 3596810 Pterocles burchelli Pterocles gutturalis 57819 Pterocles gutturalis Syrrhaptes paradoxus 817590 Syrrhaptes paradoxus Alopecoenas beccarii 550862 Alopecoenas beccarii Caloenas nicobarica 1032058 Caloenas nicobarica Columbina picui 54405 Columbina picui Prunella himalayana 795159 Prunella himalayana Columba livia 938416 Columba livia Patagioenas fasciata 148378 Patagioenas fasciata Tauraco erythrolophus 487306 Tauraco erythrolophus Corythaeola cristata 842345 Corythaeola cristata Corythaixoides concolor 842342 Corythaixoides concolor Lophotis ruficrista 5031 Lophotis ruficrista Ardeotis kori 521837 Ardeotis kori Chlamydotis macqueenii 787600 Chlamydotis macqueenii Geococcyx californianus 212182 Geococcyx californianus Crotophaga sulcirostris 1041415 Crotophaga sulcirostris Passer domesticus 745175 Passer domesticus Centropus bengalensis 4947399 Centropus bengalensis Centropus unirufus 595245 Centropus unirufus Cuculus canorus 792628 Cuculus canorus Ceuthmochares aereus 3602243 Ceuthmochares aereus Piaya cayana 891422 Piaya cayana Struthio camelus 647692 Struthio camelus Casuarius casuarius 589152 Casuarius casuarius Dromaius novaehollandiae 829513 Dromaius novaehollandiae Apteryx haastii 241836 Apteryx haastii Apteryx owenii 241844 Apteryx owenii Hypocryptadius cinnamomeus 840030 Hypocryptadius cinnamomeus Apteryx australis 241834 Apteryx australis Apteryx rowi 165688 Apteryx rowi Rhea americana 857864 Rhea americana Rhea pennata 857860 Pterocnemia pennata Eudromia elegans 292461 Eudromia elegans Nothoprocta perdicaria 402446 Nothoprocta perdicaria Nothoprocta ornata 332613 Nothoprocta ornata Nothoprocta pentlandii 3600805 Nothoprocta pentlandii Nothocercus julius 3600814 Nothocercus julius Nothocercus nigrocapillus 3600813 Nothocercus nigrocapillus Motacilla alba 695336 Motacilla alba Tinamus guttatus 306216 Tinamus guttatus Crypturellus soui 960236 Crypturellus soui Crypturellus cinnamomeus 3600791 Crypturellus cinnamomeus Crypturellus undulatus 870607 Crypturellus undulatus Chlorodrepanis virens 157610 Hemignathus virens Hemignathus wilsoni 324561 Hemignathus wilsoni Serinus canaria 464865 Serinus canaria Gallus gallus 153563 Gallus gallus Loxia curvirostra 298778 Loxia curvirostra Loxia leucoptera 1060528 Loxia leucoptera Rhodinocichla rosea 817637 Rhodinocichla rosea Calcarius ornatus 765406 Calcarius ornatus Emberiza fucata 802893 Emberiza fucata Pheucticus melanocephalus 425436 Pheucticus melanocephalus Cardinalis cardinalis 307364 Cardinalis cardinalis Passerina amoena 119888 Passerina amoena Nesospiza acunhae 957952 Nesospiza acunhae Geospiza fortis 589951 Geospiza fortis Coturnix japonica 803622 Coturnix japonica Sporophila hypoxantha 128450 Sporophila hypoxantha Spizella passerina 989504 Spizella passerina Melospiza melodia 265548 Melospiza melodia Junco hyemalis 989502 Junco hyemalis Zonotrichia albicollis 265547 Zonotrichia albicollis Setophaga coronata 451168 Setophaga coronata Setophaga kirtlandii 34665 Setophaga kirtlandii Agelaius phoeniceus 226605 Agelaius phoeniceus Molothrus ater 213450 Molothrus ater Quiscalus mexicanus 743411 Quiscalus mexicanus Phasianus colchicus 102719 Phasianus colchicus Urocynchramus pylzowi 469177 Urocynchramus pylzowi Ploceus nigricollis 282521 Ploceus nigricollis Vidua chalybeata 622887 Vidua chalybeata Vidua macroura 175250 Vidua macroura Lonchura striata 306760 Lonchura striata Taeniopygia guttata 708327 Taeniopygia guttata Bombycilla garrulus 613881 Bombycilla garrulus Phainopepla nitens 33427 Phainopepla nitens Regulus satrapa 3599325 Regulus satrapa Tichodroma muraria 452744 Tichodroma muraria Meleagris gallopavo 446482 Meleagris gallopavo Sitta europaea 82242 Sitta europaea Polioptila caerulea 443266 Polioptila caerulea Thryothorus ludovicianus 1036137 Thryothorus ludovicianus Certhia brachydactyla 1007172 Certhia brachydactyla Certhia familiaris 1007196 Certhia familiaris Elachura formosa 3598440 Spelaeornis formosus Buphagus erythrorhynchus 968664 Buphagus erythrorhynchus Toxostoma redivivum 1085996 Toxostoma redivivum Rhabdornis inornatus 482511 Rhabdornis inornatus Leucopsar rothschildi 863246 Leucopsar rothschildi Tympanuchus cupido 728073 Tympanuchus cupido Sturnus vulgaris 565813 Sturnus vulgaris Cinclus mexicanus 606627 Cinclus mexicanus Catharus fuscescens 545761 Catharus fuscescens Cercotrichas coryphaeus 884746 Cercotrichas coryphoeus Copsychus sechellarum 662919 Copsychus sechellarum Erithacus rubecula 507122 Erithacus rubecula Ficedula albicollis 107840 Ficedula albicollis Oenanthe oenanthe 1092950 Oenanthe oenanthe Saxicola maurus 546578 Saxicola maurus Anthoscopus minutus 73144 Anthoscopus minutus Numida meleagris 684046 Numida meleagris Poecile atricapillus 17262 Poecile atricapillus Parus major 515143 Parus major Pseudopodoces humilis 875992 Pseudopodoces humilis Alaudala cheleensis 947048 Alaudala cheleensis Panurus biarmicus 3599884 Panurus biarmicus Nicator chloris 814747 Nicator chloris Sylvietta virens 759577 Sylvietta virens Cisticola juncidis 24056 Cisticola juncidis Acrocephalus arundinaceus 800677 Acrocephalus arundinaceus Hippolais icterina 433851 Hippolais icterina ot:undefined node37 tree1_ROOT false true true true true true true true true true true true true true 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true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true ot:time Myr Bayesian inference node726 false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true 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