Crespo A.
Leavitt S.
Divakar P.K.
Lumbsch H.T.
Alors D.
Alors D., Lumbsch H.T., Divakar P.K., Leavitt S., & Crespo A.
2016-02-05
PLoS ONE
taxonomy
species delimitation
parmelioid lichens
new species
lichenized fungi
Lecanorales
cryptic species
An Integrative Approach for Understanding Diversity in the Punctelia rudecta Species Complex (Parmeliaceae, Ascomycota).
Alors D., Lumbsch H.T., Divakar P.K., Leavitt S., & Crespo A. 2016. An Integrative Approach for Understanding Diversity in the Punctelia rudecta Species Complex (Parmeliaceae, Ascomycota). PLoS ONE, 11(2): e0146537.
pythonVersion
2.7.9
pythonImplementation
CPython
Ascomycetes
$1
^(\S*\s+\S*).*
false
^dc:contributor
^dc:creator
^dc:date
^dc:publisher
^dc:subject
^dc:title
^dcterms:bibliographicCitation
^ot:comment
^prism:creationDate
^prism:doi
^prism:modificationDate
^prism:number
^prism:publicationDate
^prism:publicationName
^prism:section
^prism:volume
^skos:changeNote
^skos:historyNote
^tb:identifier.study
^tb:title.study
@label
^skos:historyNote
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
^skos:prefLabel
@label
Tl1991889
Tl1991923
Tl1991929
Tl1991933
Tl1991935
Tl1991937
Tl1991946
Tl1991949
Tl1991950
Tl1991952
Tl1991958
Tl1991966
Tl1991968
Tl1991970
Tl1991891
Tl1991894
Tl1991897
Tl1991909
Tl1991913
Tl1991917
Tl1991931
Tl1991956
Tl1991957
Tl1991963
Tl1991976
Tl1991977
Tl1991892
Tl1991895
Tl1991896
Tl1991898
Tl1991899
Tl1991904
Tl1991905
Tl1991907
Tl1991912
Tl1991915
Tl1991921
Tl1991927
Tl1991928
Tl1991930
Tl1991939
Tl1991940
Tl1991941
Tl1991942
Tl1991943
Tl1991944
Tl1991945
Tl1991947
Tl1991951
Tl1991955
Tl1991964
Tl1991967
Tl1991969
Tl1991971
Tl1991972
Tl1991973
Tl1991975
Tl1991893
Tl1991903
Tl1991936
Tl1991900
Tl1991962
Tl1991901
Tl1991902
Tl1991911
Tl1991914
Tl1991919
Tl1991920
Tl1991925
Tl1991954
Tl1991906
Tl1991934
Tl1991953
Tl1991961
Tl1991910
Tl1991916
Tl1991926
Tl1991948
Tl1991959
Tl1991974
Tl1991922
Tl1991932
Tl1991938
^skos:historyNote
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:nodeLabelMode
^ot:nodeLabelTimeUnit
^tb:ntax.tree
^ot:ottId
Tr90392
Dail Laughinghouse
794602
Punctelia
false
ot_701
David Alors, H. Thorsten Lumbsch, Pradeep K. Divakar, Steven D. Leavitt, Ana Crespo, 2016, 'An Integrative Approach for Understanding Diversity in the Punctelia rudecta Species Complex (Parmeliaceae, Ascomycota)', PLOS ONE, vol. 11, no. 2, p. e0146537
2016
2015-08-10
10.1371/journal.pone.0146537
2016-02-05
2
2016
PLoS ONE
Study
11
Generated on Fri Apr 15 20:15:24 UTC 2016
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlDocumentWriter@60e31714 $Rev: 1060 $
18070
An integrative approach for understanding species diversity in the Punctelia rudecta complex (Parmeliaceae, Ascomycota)
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlOTUWriter@1346e62b $Rev: 1040 $
Punctelia appalachiensis 10253 K
Punctelia subpraesignis H
510739
Punctelia subpraesignis
Punctelia borreri 10237 I
682353
Punctelia borreri
Punctelia rudecta 3157 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia hypoleucites AFTOL B
767392
Punctelia hypoleucites
Punctelia borreri 16125 I
682353
Punctelia borreri
Punctelia rudecta 1197 Kenya
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 7661 B
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia borreri 10240 I
682353
Punctelia borreri
Punctelia rudecta 3521 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 3149 Japana
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia perreticulata 10 M
311547
Punctelia perreticulata
Punctelia subrudecta 10243 N
872116
Punctelia subrudecta
Punctelia subrudecta 10241 N
872116
Punctelia subrudecta
Punctelia hypoleucites 1179 Kenya
767392
Punctelia hypoleucites
Punctelia rudecta 10256 A
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 1196 Kenya
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia jeckeri 10249 D
340986
Punctelia jeckeri
Punctelia subflava E
311283
Punctelia subflava
Punctelia reddenda 10247 G
311549
Punctelia reddenda
Punctelia borreri 3216 Australia
682353
Punctelia borreri
Punctelia caseana NY48 C
926990
Punctelia caseana
Punctelia subrudecta 3219 Australia
872116
Punctelia subrudecta
Punctelia rudecta 3164 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia borreri 10254 I
682353
Punctelia borreri
Punctelia subrudecta PARS3 N
872116
Punctelia subrudecta
Punctelia rudecta AFTOL9 B
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia caseana 3162 USA
926990
Punctelia caseana
Punctelia borreri 030736 I
682353
Punctelia borreri
Punctelia toxodes 1119 South Africa
3768261
Punctelia toxodes
Punctelia subrudecta 10250 N
872116
Punctelia subrudecta
Punctelia subrudecta 10242 N
872116
Punctelia subrudecta
Punctelia rudecta 1195 Kenya
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia pseudocoralloidea E
872117
Punctelia pseudocoralloidea
Punctelia sticta Peru F
Punctelia bolliana
3768257
Punctelia bolliana
Punctelia subrudecta 10244 N
872116
Punctelia subrudecta
Punctelia caseana 3163 USA
926990
Punctelia caseana
Punctelia rudecta 3158 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 3155 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia guanchica 3142 Canary
Punctelia rudecta 3152 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia borreri 10246 I
682353
Punctelia borreri
Punctelia pseudocoralloidea 3217 Australia
872117
Punctelia pseudocoralloidea
Punctelia ruderata 3145 India
Punctelia jeckeri NY276 D
340986
Punctelia jeckeri
Punctelia guanchica 3138 Canary
Punctelia hypoleucites 3911 Cuba
767392
Punctelia hypoleucites
Punctelia guanchica 3136 Canary
Punctelia pseudocoralloidea 3218 Australia
872117
Punctelia pseudocoralloidea
Punctelia rudecta 3146 India
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 1193 Kenya
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 3153 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 3147 Japana
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 3910 Chile
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 3160 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 3522 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia appalachiensis 3520Us P
Punctelia rudecta 1190 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia caseana NY284 C
926990
Punctelia caseana
Punctelia guanchica 1189 Canary
Flavopunctelia soredicar T
Punctelia rudecta 3519 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia guanchica 1188 Canary
Punctelia jeckeri 10251 D
340986
Punctelia jeckeri
Punctelia subrudecta 10245 N
872116
Punctelia subrudecta
Punctelia rudecta Normo B
311283
Punctelia subflava
Punctelia borreri 10255 I
682353
Punctelia borreri
Punctelia borreri 3215 Australia
682353
Punctelia borreri
Punctelia guanchica 3139 Canary
Punctelia caseana 3161 USA
926990
Punctelia caseana
Punctelia missouriensis L
649527
Punctelia missouriensis
Punctelia jeckeri NY323 D
340986
Punctelia jeckeri
Punctelia perreticulata 16 M
311547
Punctelia perreticulata
Punctelia borreri 090011 J
682353
Punctelia borreri
Punctelia rudecta 1240 Japana
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Flavopunctelia flaventior
733708
Flavopunctelia flaventior
Punctelia guanchica 3143 Canary
Punctelia rudecta 3156 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia guanchica 3141 Canary
Punctelia rudecta 3150 Kenya
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia guanchica 1187 Canary
Punctelia rudecta 1343 Chile
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 1239 Japana
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia rudecta 3159 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia caseana NY160 C
926990
Punctelia caseana
Punctelia rudecta 3154 USA
311283
Punctelia subflava
Punctelia aff. rudecta
Punctelia borreri 080105 I
682353
Punctelia borreri
Punctelia borreri 10238 I
682353
Punctelia borreri
Mapped from TreeBASE schema using org.cipres.treebase.domain.nexus.nexml.NexmlTreeBlockWriter@6f86ca2a $Rev: 1040 $
ot:posteriorSupport
Myr
Bayesian inference
Tn13283071
Tn13283059
false
89
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
true
false
true
false
true
false
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false