pythonVersion
2.7.9
pythonImplementation
CPython
Cnidarians
Sinularia
^S
_
_
$1
^(\S*\s+\S*).*
Lobophytum
^L
false
Source data for tree(s) 'tree1'
tree1
Source data for tree(s) 'tree2'
tree2
Source data for tree(s) 'tree3'
tree3
^ot:ottId
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
otu101
otu31
otu102
otu12
otu27
otu85
otu104
otu76
otu105
otu110
otu13
otu37
otu39
otu46
otu92
otu94
otu108
otu109
otu11
otu33
otu42
otu61
otu113
otu65
otu119
otu3
otu121
otu125
otu166
otu167
otu122
otu131
otu123
otu126
otu141
otu143
otu153
otu177
otu188
otu189
otu202
otu124
otu129
otu127
otu195
otu128
otu201
otu130
otu155
otu132
otu136
otu139
otu171
otu173
otu176
otu178
otu185
otu197
otu133
otu154
otu135
otu169
otu137
otu138
otu174
otu183
otu184
otu193
otu14
otu89
otu144
otu152
otu157
otu159
otu162
otu145
otu170
otu158
otu179
otu196
otu168
otu181
otu194
otu180
otu187
otu192
otu19
otu4
otu56
otu60
otu73
otu90
otu2
otu36
otu20
otu50
otu204
otu209
otu226
otu206
otu217
otu207
otu211
otu212
otu213
otu221
otu222
otu229
otu231
otu215
otu219
otu216
otu220
otu224
otu228
otu230
otu22
otu83
otu91
otu26
otu68
otu28
otu59
otu30
otu47
otu45
otu51
otu63
otu48
otu5
otu49
otu69
otu53
otu82
otu77
otu78
otu81
otu98
^ot:comment
^ot:nodeLabelMode
^ot:nodeLabelTimeUnit
^ot:branchLengthTimeUnit
^ot:nodeLabelMode
^ot:nodeLabelTimeUnit
^ot:nodeLabelMode
^ot:nodeLabelTimeUnit
tree1
tree2
tree3
Trees for Sinularia, Cladiella+Klyxum and Sarcophyton+Lobophytum. Reference species plus species from Penghu, Taiwan
Catherine McFadden
244270
Alcyoniidae
false
ot_947
Benayahu Y, Ofwegen LP van, Soong K, Dai C-F, Jeng M-S, Shlagman A, Hsieh HJ, McFadden CS (2013) Diversity and distribution of Octocorals (Coelenterata: Anthozoa) on the coral reefs of Penghu, Taiwan. Zoological Studies 51: 1529-1548.
2013
S_gaveshaniae_RMNH_Coel.38733
264001
Sinularia gaveshaniae
S halversoni NTM C14058
787447
Sinularia halversoni
S_compacta_RMNH_Coel.38433
955589
Sinularia compacta
S gaweli UF3181
723371
Sinularia gaweli
S intacta NTM C12479
161919
Sinularia molesta
accDQ280559
310966
Lobophytum compactum
S leptoclados ZMTAU CO34095
213052
Sinularia leptoclados
S ornata NTM C13971
684961
Sinularia ornata
S terspilli ZMTAU CO34156
334774
Sinularia terspilli
S_uniformis_RMNH_Coel.38753
960313
Sinularia uniformis
S_siaesensis_RMNH_Coel.38746
960321
Sinularia siaesensis
S_siaesensis_RMNH_Coel.38747
960321
Sinularia siaesensis
S polydactyla NTM C14173
514624
Sinularia polydactyla
S peculiaris ZMTAU CO34643
684961
Sinularia ornata
S loyai ZMTAU CO34154
213056
Sinularia loyai
S daii ZMTAU CO34665
5231864
Sinularia daii
S peculiaris NTM C14092
684959
Sinularia peculiaris
accDQ280549
723366
Sarcophyton trocheliophorum
S rigida NTM C14141
1041085
Sinularia rigida
S papula NTM C14527
161824
Sinularia papula
S robusta NTM C14518
1041083
Sinularia robusta
S_babeldaobensis_RMNH_Coel.38723
909312
Sinularia babeldaobensis
S_pavida_RMNH_Coel.38744
684965
Sinularia pavida
S rotundata NTM C3755
161919
Sinularia molesta
S_verruca_RMNH_Coel.38754
960315
Sinularia verruca
L sarcophytoides NTM C3792
92592
Lobophytum sarcophytoides
S gemmatum ZMTAU CO34091
579259
Sarcophyton gemmatum
S_glaucum_clade_D__RMNH_Coel.33069
475463
Sarcophyton glaucum
L venustum NTM C14525
92602
Lobophytum venustum
L sarcophytoides NTM C3797
92592
Lobophytum sarcophytoides
S glaucum clade G ZMTAU CO34063
475463
Sarcophyton glaucum
Sarcophyton tumulosum ZMTAU CO34698
3679242
Sarcophyton tumulosum
L strictum NTM C14937
92594
Lobophytum strictum
L venustum NTM C14529
92602
Lobophytum venustum
S ornata ZMTAU CO34712
684961
Sinularia ornata
S regulare NTM C14871
606351
Sarcophyton regulare
S gemmatum ZMTAU CO34057
579259
Sarcophyton gemmatum
S trocheliophorum NTM C014854
723366
Sarcophyton trocheliophorum
L compactum NTM C11566
310966
Lobophytum compactum
S_crassocaule_RMNH_Coel.33076
666850
Sarcophyton crassocaule
L catalai NTM C14136
310965
Lobophytum catalai
Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO34641
723366
Sarcophyton trocheliophorum
S ehrenbergi NTM C14511
606345
Sarcophyton ehrenbergi
S ehrenbergi NTM C014455
606345
Sarcophyton ehrenbergi
Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO34644
723366
Sarcophyton trocheliophorum
S cruciata NTM C13505
314102
Sinularia cruciata
S_cinereum_RMNH_Coel.33073
666849
Sarcophyton cinereum
S glaucum clade A AF063191
475463
Sarcophyton glaucum
S_nanwanensis_RMNH_Coel.33078
606352
Sarcophyton nanwanensis
S glaucum clade B NTM C13530
475463
Sarcophyton glaucum
L crassum NTM C13970
996887
Lobophytum crassum
Sarcophyton tortuosum ZMTAU CO34684
606341
Sarcophyton tortuosum
L borbonicum NTM C5514D
310971
Lobophytum borbonicum
L variatum NTM C14130
92593
Lobophytum variatum
L cryptocormum NTM C14046
310967
Lobophytum cryptocormum
S cherbonnieri NTM C13645
666852
Sarcophyton cherbonnieri
S conferta NTM C13972
314110
Sinularia conferta
L nodosum NTM C14093
92595
Lobophytum nodosum
S flexuosum NTM C13797
606343
Sarcophyton flexuosum
Lobophytum crassum ZMTAU CO34657
996887
Lobophytum crassum
S_glaucum_clade_C_RMNH_Coel.33072
475463
Sarcophyton glaucum
L compactum NTM C10561
310966
Lobophytum compactum
S cf regulare NTM C13982
606351
Sarcophyton regulare
S boettgeri NTM C14181
666854
Sarcophyton boettgeri
L_crassum_RMNH_Coel.33063
996887
Lobophytum crassum
L pauciflorum UF2856
723365
Lobophytum pauciflorum
L_crassum_RMNH_Coel.33060
996887
Lobophytum crassum
S mammifera NTM C14198
965408
Sinularia mammifera
L legitimum NTM C13980
310963
Lobophytum legitimum
S auritum ZMTAU CO34060
579257
Sarcophyton auritum
L_crassum_RMNH_Coel.33061
996887
Lobophytum crassum
L densum NTM C14090
310968
Lobophytum densum
L schoedei NTM C14149
3679076
Lobophytum schoedei
S_mililatensis_RMNH_Coel.33080
606344
Sarcophyton mililatensis
L_sarcophytoides_RMNH_Coel.33064
92592
Lobophytum sarcophytoides
L_sarcophytoides_RMNH_Coel.33065
92592
Lobophytum sarcophytoides
S elegans UF2637
606349
Sarcophyton elegans
L catalai NTM C14013
310965
Lobophytum catalai
S foveolata NTM C13966
1009663
Sinularia foveolata
S tortuosum NTM C14129
606341
Sarcophyton tortuosum
S trocheliophorum UF2638
723366
Sarcophyton trocheliophorum
L batarum NTM C10600
310970
Lobophytum batarum
Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO34662
723366
Sarcophyton trocheliophorum
Sarcophyton ehrenbergi ZMTAU CO34705
606345
Sarcophyton ehrenbergi
S digitatum NTM C13803
666860
Sarcophyton digitatum
Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO33621
723366
Sarcophyton trocheliophorum
S_glaucum_clade_F_RMNH_Coel.33070
475463
Sarcophyton glaucum
Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO34660
723366
Sarcophyton trocheliophorum
L pauciflorum NTM C14161
723365
Lobophytum pauciflorum
S humesi UF3500
787441
Sinularia humesi
Lobophytum hsiehi ZMTAU CO34694
5231856
Lobophytum hsiehi
S elegans NTM C14888
606349
Sarcophyton elegans
S crassum NTM C14118
666859
Sarcophyton crassum
S_ehrenbergi_RMNH_Coel.33077
606345
Sarcophyton ehrenbergi
S ehrenbergi NTM C11208
606345
Sarcophyton ehrenbergi
S trocheliophorum NTM C14469
723366
Sarcophyton trocheliophorum
L ransoni NTM C13929
92597
Lobophytum ransoni
Lobophytum hsiehi ZMTAU CO34717
5231856
Lobophytum hsiehi
S glaucum clade A NTM C14002
475463
Sarcophyton glaucum
S glaucum clade E NTM C14113
475463
Sarcophyton glaucum
S penghuensis ZMTAU CO34659
5231860
Sinularia penghuensis
S_buitendikji_RMNH_Coel.33079
666851
Sarcophyton buitendijki
S pauciplicatum ZMTAU CO34135
579261
Sarcophyton pauciplicatum
Lobophytum hsiehi ZMTAU CO33593
5231856
Lobophytum hsiehi
S ehrenbergi NTM C14251
606345
Sarcophyton ehrenbergi
S elegans NTM C14460
606349
Sarcophyton elegans
Sarcophyton tumulosum ZMTAU CO34710
3679242
Sarcophyton tumulosum
L_pauciflorum_RMNH_Coel.33068
723365
Lobophytum pauciflorum
Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO33634
723366
Sarcophyton trocheliophorum
L patulum NTM C13965
92598
Lobophytum patulum
L hirsutum NTM C13987
310962
Lobophytum hirsutum
S parulekari NTM C14249
684967
Sinularia parulekari
S abrupta ZMTAU CO33623
3679277
Sinularia abrupta
L mirabile NTM C11559
92596
Lobophytum mirabile
L strictum NTM C11271
92594
Lobophytum strictum
S_glaucum_clade_A_RMNH_Coel.33074
475463
Sarcophyton glaucum
Cladiella tuberosa ZMTAU CO34669
3679114
Cladiella tuberosa
Cladiella kashmani ZMTAU CO32482
3679104
Cladiella kashmani
Cladiella sphaerophora ZMTAU CO34132
1040742
Cladiella sphaerophora
Cladiella australis ZMTAU CO33613
3679122
Cladiella australis
Klyxum utinomii ZMTAU CO34127
463892
Klyxum utinomii
Klyxum adii ZMTAU CO32636
3679388
Klyxum adii
Cladiella kashmani ZMTAU CO32246
3679104
Cladiella kashmani
S_digitata_RMNH_Coel.38727
383987
Sinularia digitata
Metalcyonium verseveldti ZMTAU CO33097
579267
Alcyonium verseveldti
Klyxum utinomii ZMTAU CO34674
463892
Klyxum utinomii
Klyxum utinomii ZMTAU CO34692
463892
Klyxum utinomii
Klyxum utinomii ZMTAU CO34672
463892
Klyxum utinomii
Cladiella bottai ZMTAU CO34648
3679136
Cladiella bottai
Cladiella tuberculoides ZMTAU CO34642
3679150
Cladiella tuberculoides
Cladiella pachyclados PAL384
437930
Cladiella pachyclados
Cladiella australis ZMTAU CO33622
3679122
Cladiella australis
Klyxum flaccidum ZMTAU CO32221
3679386
Klyxum flaccidum
Cladiella tuberculoides ZMTAU CO34686
3679150
Cladiella tuberculoides
S wanannensis ZMTAU CO34695
5231861
Sinularia wanannensis
Cladiella pachyclados ZMTAU CO33604
437930
Cladiella pachyclados
Klyxum utinomii ZMTAU CO34636
463892
Klyxum utinomii
Klyxum utinomii ZMTAU CO34639
463892
Klyxum utinomii
Aldersladum sodwanum ZMTAU CO31520
3679418
Aldersladum sodwanum
Cladiella pachyclados ZMTAU CO34129
437930
Cladiella pachyclados
Aldersladum jengi ZMTAU CO33607
3679405
Aldersladum jengi
Cladiella kashmani ZMTAU CO32334
3679104
Cladiella kashmani
Cladiella krempfi ZMTAU CO33592
3679149
Cladiella krempfi
Cladiella pachyclados PAL145
437930
Cladiella pachyclados
Klyxum utinomii ZMTAU CO33581
463892
Klyxum utinomii
S grandilobata NTM C13796
263990
Sinularia grandilobata
Cladiella pachyclados ZMTAU CO34130
437930
Cladiella pachyclados
Klyxum utinomii ZMTAU CO33612
463892
Klyxum utinomii
S mauritiana NTM C13852
736738
Sinularia mauritiana
S linnei NTM C14480
383985
Sinularia linnei
S maxima NTM C14255
1050401
Sinularia maxima
S_molesta_RMNH_Coel.38440
161919
Sinularia molesta
S acuta ZMTAU CO33617
909310
Sinularia acuta
S_bisulca_RMNH_Coel.38724
909314
Sinularia bisulca
S gibberosa ZMTAU CO33630
684965
Sinularia pavida
S peculiaris ZMTAU CO33658
S gaweli UF3498
723371
Sinularia gaweli
S lochmodes ZMTAU CO33648
1040266
Sinularia lochmodes
S_polydactyla_RMNH_Coel.38442
514624
Sinularia polydactyla
accDQ280593
554156
Dampia pocilloporaeformis
S_abhishiktae_RMNH_Coel.38720
379387
Sinularia abhishiktae
S parulekari NTM C13989
684967
Sinularia parulekari
S ornata ZMTAU CO34651
684961
Sinularia ornata
S_luxuriosa_RMNH_Coel.38742
383977
Sinularia luxuriosa
S ornata ZMTAU CO34650
684961
Sinularia ornata
S penghuensis ZMTAU CO34706
5231860
Sinularia penghuensis
S_humilis_RMNH_Coel.38737
383981
Sinularia humilis
S gibberosa ZMTAU CO33611
3679260
Sinularia gibberosa
S polydactyla ZMTAU CO34106
514624
Sinularia polydactyla
S muralis NTM C13978
161917
Sinularia muralis
S densa NTM C1993
1079236
Sinularia densa
S compressa ZMTAU CO34140
314108
Sinularia compressa
S ornata NTM C14138
684961
Sinularia ornata
S peculiaris ZMTAU CO34683
S heterospiculata NTM C14003
787445
Sinularia heterospiculata
S variabilis NTM C14134
334772
Sinularia variabilis
S heterospiculata NTM C13968
787445
Sinularia heterospiculata
S abrupta NTM C14012
3679277
Sinularia abrupta
S compressa ZMTAU CO34142
314108
Sinularia compressa
accDQ280512
606345
Sarcophyton ehrenbergi
S erecta ZMTAU CO34144
838567
Sinularia erecta
S woodyensis NTM C14557
960310
Sinularia woodyensis
S_foliata_RMNH_Coel.38732
383983
Sinularia foliata
S penghuensis ZMTAU CO34739
5231860
Sinularia penghuensis
S_sobolifera_RMNH_Coel.38748
751464
Sinularia sobolifera
S_flexibilis_RMNH_Coel.38378
921124
Sinularia flexibilis
S_acuta_RMNH_Coel._38721
909310
Sinularia acuta
S vrijmoethi NTM C14095
334777
Sinularia vrijmoethi
S penghuensis ZMTAU CO34630
5231860
Sinularia penghuensis
S polydactyla NTM C14142
514624
Sinularia polydactyla
S dura NTM C13808
838570
Sinularia dura
S_compressa_RMNH_Coel.38420
314108
Sinularia compressa
S_crassa_RMNH_Coel.38430
314106
Sinularia crassa
S peculiaris ZMTAU CO34707
684959
Sinularia peculiaris
S capitalis NTM C14530
955592
Sinularia capitalis
S cristata NTM C13818
314100
Sinularia cristata
S maxima NTM C14512
1050401
Sinularia maxima
S variabilis NTM C14164
334772
Sinularia variabilis
S fungoides NTM C13910
473262
Sinularia fungoides
S confusa NTM C14456
909318
Sinularia confusa
S gardineri ZMTAU CO34097
473266
Sinularia gardineri
S bremerensis NTM C14488
909316
Sinularia bremerensis
S penghuensis ZMTAU CO34681
5231860
Sinularia penghuensis
S slieringsi ZMTAU CO34654
3679344
Sinularia slieringsi
S_depressa_RMNH_Coel.38428
314098
Sinularia depressa
S leptoclados NTM C14492
213052
Sinularia leptoclados
S querciformis ZMTAU CO34191
514618
Sinularia querciformis
S querciformis ZMTAU CO34096
514618
Sinularia querciformis
S_procera_RMNH_Coel.38386
1040556
Sinularia procera
S brassica NTM C13660
955594
Sinularia brassica
S diffusa NTM C14464
383989
Sinularia diffusa
S lamellata NTM C13824
213054
Sinularia lamellata
S erecta ZMTAU CO33585
838567
Sinularia erecta
S wanannensis ZMTAU CO34700
5231861
Sinularia wanannensis
S notanda NTM C14555
962995
Sinularia notanda
S molesta ZMTAU CO33615
161919
Sinularia molesta
S hirta ZMTAU CO34100
787443
Sinularia hirta
S_nanolobata_RMNH_Coel.38441
962993
Sinularia nanolobata
S scabra NTM C14043
1041087
Sinularia scabra
S cruciata ZMTAU CO34152
314102
Sinularia cruciata
S numerosa NTM C13790
684963
Sinularia numerosa
S penghuensis ZMTAU CO34691
5231860
Sinularia penghuensis
S wanannensis ZMTAU CO34704
5231861
Sinularia wanannensis
S ornata ZMTAU CO34646
684961
Sinularia ornata
S_longula_RMNH_Coel.38439
383979
Sinularia longula
S ornata ZMTAU CO34647
684961
Sinularia ornata
S_crebra_RMNH_Coel.38726
1059556
Sinularia crebra
S_curvata_RMNH_Coel.38436
1059559
Sinularia curvata
S soongi ZMTAU CO33632
5231870
Sinularia soongi
S lamellata NTM C13931
213054
Sinularia lamellata
S_flaccida_RMNH_Coel.38731
383991
Sinularia flaccida
ot:undefined
Maximum likelihood
tree1_ROOT
tree1_ROOT
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
true
true
ot:undefined
Maximum likelihood
tree2_ROOT
tree2_ROOT
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
ot:undefined
Maximum likelihood
tree3_ROOT
tree3_ROOT
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
false
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true