pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython Cnidarians Sinularia ^S _ _ $1 ^(\S*\s+\S*).* Lobophytum ^L false Source data for tree(s) 'tree1' tree1 Source data for tree(s) 'tree2' tree2 Source data for tree(s) 'tree3' tree3 ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar otu105 otu110 otu13 otu37 otu39 otu46 otu92 otu94 otu121 otu125 otu166 otu167 ^ot:comment ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit ^ot:ottId otu101 otu31 otu102 otu12 otu27 otu85 otu104 otu76 otu108 otu109 otu11 otu33 otu42 otu61 otu113 otu65 otu119 otu3 otu122 otu131 otu123 otu126 otu141 otu143 otu153 otu177 otu188 otu189 otu202 otu124 otu129 otu127 otu195 otu128 otu201 otu130 otu155 otu132 otu136 otu139 otu171 otu173 otu176 otu178 otu185 otu197 otu133 otu154 otu135 otu169 otu137 otu138 otu174 otu183 otu184 otu193 otu14 otu89 otu144 otu152 otu157 otu159 otu162 otu145 otu170 otu158 otu179 otu196 otu168 otu181 otu194 otu180 otu187 otu192 otu19 otu4 otu56 otu60 otu73 otu90 otu2 otu36 otu20 otu50 otu204 otu209 otu226 otu206 otu217 otu207 otu211 otu212 otu213 otu221 otu222 otu229 otu231 otu215 otu219 otu216 otu220 otu224 otu228 otu230 otu22 otu83 otu91 otu26 otu68 otu28 otu59 otu30 otu47 otu45 otu51 otu63 otu48 otu5 otu49 otu69 otu53 otu82 otu77 otu78 otu81 otu98 tree1 tree2 tree3 Trees for Sinularia, Cladiella+Klyxum and Sarcophyton+Lobophytum. Reference species plus species from Penghu, Taiwan Catherine McFadden 244270 Alcyoniidae false ot_947 Benayahu Y, Ofwegen LP van, Soong K, Dai C-F, Jeng M-S, Shlagman A, Hsieh HJ, McFadden CS (2013) Diversity and distribution of Octocorals (Coelenterata: Anthozoa) on the coral reefs of Penghu, Taiwan. Zoological Studies 51: 1529-1548. 2013 S_gaveshaniae_RMNH_Coel.38733 264001 Sinularia gaveshaniae S halversoni NTM C14058 787447 Sinularia halversoni S_compacta_RMNH_Coel.38433 955589 Sinularia compacta S gaweli UF3181 723371 Sinularia gaweli S intacta NTM C12479 161919 Sinularia molesta accDQ280559 310966 Lobophytum compactum S leptoclados ZMTAU CO34095 213052 Sinularia leptoclados S ornata NTM C13971 684961 Sinularia ornata S terspilli ZMTAU CO34156 334774 Sinularia terspilli S_uniformis_RMNH_Coel.38753 960313 Sinularia uniformis S_siaesensis_RMNH_Coel.38746 960321 Sinularia siaesensis S_siaesensis_RMNH_Coel.38747 960321 Sinularia siaesensis S polydactyla NTM C14173 514624 Sinularia polydactyla S peculiaris ZMTAU CO34643 684961 Sinularia ornata S loyai ZMTAU CO34154 213056 Sinularia loyai S daii ZMTAU CO34665 5231864 Sinularia daii S peculiaris NTM C14092 684959 Sinularia peculiaris accDQ280549 723366 Sarcophyton trocheliophorum S rigida NTM C14141 1041085 Sinularia rigida S papula NTM C14527 161824 Sinularia papula S robusta NTM C14518 1041083 Sinularia robusta S_babeldaobensis_RMNH_Coel.38723 909312 Sinularia babeldaobensis S_pavida_RMNH_Coel.38744 684965 Sinularia pavida S rotundata NTM C3755 161919 Sinularia molesta S_verruca_RMNH_Coel.38754 960315 Sinularia verruca L sarcophytoides NTM C3792 92592 Lobophytum sarcophytoides S gemmatum ZMTAU CO34091 579259 Sarcophyton gemmatum S_glaucum_clade_D__RMNH_Coel.33069 475463 Sarcophyton glaucum L venustum NTM C14525 92602 Lobophytum venustum L sarcophytoides NTM C3797 92592 Lobophytum sarcophytoides S glaucum clade G ZMTAU CO34063 475463 Sarcophyton glaucum Sarcophyton tumulosum ZMTAU CO34698 3679242 Sarcophyton tumulosum L strictum NTM C14937 92594 Lobophytum strictum L venustum NTM C14529 92602 Lobophytum venustum S ornata ZMTAU CO34712 684961 Sinularia ornata S regulare NTM C14871 606351 Sarcophyton regulare S gemmatum ZMTAU CO34057 579259 Sarcophyton gemmatum S trocheliophorum NTM C014854 723366 Sarcophyton trocheliophorum L compactum NTM C11566 310966 Lobophytum compactum S_crassocaule_RMNH_Coel.33076 666850 Sarcophyton crassocaule L catalai NTM C14136 310965 Lobophytum catalai Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO34641 723366 Sarcophyton trocheliophorum S ehrenbergi NTM C14511 606345 Sarcophyton ehrenbergi S ehrenbergi NTM C014455 606345 Sarcophyton ehrenbergi Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO34644 723366 Sarcophyton trocheliophorum S cruciata NTM C13505 314102 Sinularia cruciata S_cinereum_RMNH_Coel.33073 666849 Sarcophyton cinereum S glaucum clade A AF063191 475463 Sarcophyton glaucum S_nanwanensis_RMNH_Coel.33078 606352 Sarcophyton nanwanensis S glaucum clade B NTM C13530 475463 Sarcophyton glaucum L crassum NTM C13970 996887 Lobophytum crassum Sarcophyton tortuosum ZMTAU CO34684 606341 Sarcophyton tortuosum L borbonicum NTM C5514D 310971 Lobophytum borbonicum L variatum NTM C14130 92593 Lobophytum variatum L cryptocormum NTM C14046 310967 Lobophytum cryptocormum S cherbonnieri NTM C13645 666852 Sarcophyton cherbonnieri S conferta NTM C13972 314110 Sinularia conferta L nodosum NTM C14093 92595 Lobophytum nodosum S flexuosum NTM C13797 606343 Sarcophyton flexuosum Lobophytum crassum ZMTAU CO34657 996887 Lobophytum crassum S_glaucum_clade_C_RMNH_Coel.33072 475463 Sarcophyton glaucum L compactum NTM C10561 310966 Lobophytum compactum S cf regulare NTM C13982 606351 Sarcophyton regulare S boettgeri NTM C14181 666854 Sarcophyton boettgeri L_crassum_RMNH_Coel.33063 996887 Lobophytum crassum L pauciflorum UF2856 723365 Lobophytum pauciflorum L_crassum_RMNH_Coel.33060 996887 Lobophytum crassum S mammifera NTM C14198 965408 Sinularia mammifera L legitimum NTM C13980 310963 Lobophytum legitimum S auritum ZMTAU CO34060 579257 Sarcophyton auritum L_crassum_RMNH_Coel.33061 996887 Lobophytum crassum L densum NTM C14090 310968 Lobophytum densum L schoedei NTM C14149 3679076 Lobophytum schoedei S_mililatensis_RMNH_Coel.33080 606344 Sarcophyton mililatensis L_sarcophytoides_RMNH_Coel.33064 92592 Lobophytum sarcophytoides L_sarcophytoides_RMNH_Coel.33065 92592 Lobophytum sarcophytoides S elegans UF2637 606349 Sarcophyton elegans L catalai NTM C14013 310965 Lobophytum catalai S foveolata NTM C13966 1009663 Sinularia foveolata S tortuosum NTM C14129 606341 Sarcophyton tortuosum S trocheliophorum UF2638 723366 Sarcophyton trocheliophorum L batarum NTM C10600 310970 Lobophytum batarum Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO34662 723366 Sarcophyton trocheliophorum Sarcophyton ehrenbergi ZMTAU CO34705 606345 Sarcophyton ehrenbergi S digitatum NTM C13803 666860 Sarcophyton digitatum Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO33621 723366 Sarcophyton trocheliophorum S_glaucum_clade_F_RMNH_Coel.33070 475463 Sarcophyton glaucum Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO34660 723366 Sarcophyton trocheliophorum L pauciflorum NTM C14161 723365 Lobophytum pauciflorum S humesi UF3500 787441 Sinularia humesi Lobophytum hsiehi ZMTAU CO34694 5231856 Lobophytum hsiehi S elegans NTM C14888 606349 Sarcophyton elegans S crassum NTM C14118 666859 Sarcophyton crassum S_ehrenbergi_RMNH_Coel.33077 606345 Sarcophyton ehrenbergi S ehrenbergi NTM C11208 606345 Sarcophyton ehrenbergi S trocheliophorum NTM C14469 723366 Sarcophyton trocheliophorum L ransoni NTM C13929 92597 Lobophytum ransoni Lobophytum hsiehi ZMTAU CO34717 5231856 Lobophytum hsiehi S glaucum clade A NTM C14002 475463 Sarcophyton glaucum S glaucum clade E NTM C14113 475463 Sarcophyton glaucum S penghuensis ZMTAU CO34659 5231860 Sinularia penghuensis S_buitendikji_RMNH_Coel.33079 666851 Sarcophyton buitendijki S pauciplicatum ZMTAU CO34135 579261 Sarcophyton pauciplicatum Lobophytum hsiehi ZMTAU CO33593 5231856 Lobophytum hsiehi S ehrenbergi NTM C14251 606345 Sarcophyton ehrenbergi S elegans NTM C14460 606349 Sarcophyton elegans Sarcophyton tumulosum ZMTAU CO34710 3679242 Sarcophyton tumulosum L_pauciflorum_RMNH_Coel.33068 723365 Lobophytum pauciflorum Sarcophyton trocheliophorum ZMTAU CO33634 723366 Sarcophyton trocheliophorum L patulum NTM C13965 92598 Lobophytum patulum L hirsutum NTM C13987 310962 Lobophytum hirsutum S parulekari NTM C14249 684967 Sinularia parulekari S abrupta ZMTAU CO33623 3679277 Sinularia abrupta L mirabile NTM C11559 92596 Lobophytum mirabile L strictum NTM C11271 92594 Lobophytum strictum S_glaucum_clade_A_RMNH_Coel.33074 475463 Sarcophyton glaucum Cladiella tuberosa ZMTAU CO34669 3679114 Cladiella tuberosa Cladiella kashmani ZMTAU CO32482 3679104 Cladiella kashmani Cladiella sphaerophora ZMTAU CO34132 1040742 Cladiella sphaerophora Cladiella australis ZMTAU CO33613 3679122 Cladiella australis Klyxum utinomii ZMTAU CO34127 463892 Klyxum utinomii Klyxum adii ZMTAU CO32636 3679388 Klyxum adii Cladiella kashmani ZMTAU CO32246 3679104 Cladiella kashmani S_digitata_RMNH_Coel.38727 383987 Sinularia digitata Metalcyonium verseveldti ZMTAU CO33097 579267 Alcyonium verseveldti Klyxum utinomii ZMTAU CO34674 463892 Klyxum utinomii Klyxum utinomii ZMTAU CO34692 463892 Klyxum utinomii Klyxum utinomii ZMTAU CO34672 463892 Klyxum utinomii Cladiella bottai ZMTAU CO34648 3679136 Cladiella bottai Cladiella tuberculoides ZMTAU CO34642 3679150 Cladiella tuberculoides Cladiella pachyclados PAL384 437930 Cladiella pachyclados Cladiella australis ZMTAU CO33622 3679122 Cladiella australis Klyxum flaccidum ZMTAU CO32221 3679386 Klyxum flaccidum Cladiella tuberculoides ZMTAU CO34686 3679150 Cladiella tuberculoides S wanannensis ZMTAU CO34695 5231861 Sinularia wanannensis Cladiella pachyclados ZMTAU CO33604 437930 Cladiella pachyclados Klyxum utinomii ZMTAU CO34636 463892 Klyxum utinomii Klyxum utinomii ZMTAU CO34639 463892 Klyxum utinomii Aldersladum sodwanum ZMTAU CO31520 3679418 Aldersladum sodwanum Cladiella pachyclados ZMTAU CO34129 437930 Cladiella pachyclados Aldersladum jengi ZMTAU CO33607 3679405 Aldersladum jengi Cladiella kashmani ZMTAU CO32334 3679104 Cladiella kashmani Cladiella krempfi ZMTAU CO33592 3679149 Cladiella krempfi Cladiella pachyclados PAL145 437930 Cladiella pachyclados Klyxum utinomii ZMTAU CO33581 463892 Klyxum utinomii S grandilobata NTM C13796 263990 Sinularia grandilobata Cladiella pachyclados ZMTAU CO34130 437930 Cladiella pachyclados Klyxum utinomii ZMTAU CO33612 463892 Klyxum utinomii S mauritiana NTM C13852 736738 Sinularia mauritiana S linnei NTM C14480 383985 Sinularia linnei S maxima NTM C14255 1050401 Sinularia maxima S_molesta_RMNH_Coel.38440 161919 Sinularia molesta S acuta ZMTAU CO33617 909310 Sinularia acuta S_bisulca_RMNH_Coel.38724 909314 Sinularia bisulca S gibberosa ZMTAU CO33630 684965 Sinularia pavida S peculiaris ZMTAU CO33658 S gaweli UF3498 723371 Sinularia gaweli S lochmodes ZMTAU CO33648 1040266 Sinularia lochmodes S_polydactyla_RMNH_Coel.38442 514624 Sinularia polydactyla accDQ280593 554156 Dampia pocilloporaeformis S_abhishiktae_RMNH_Coel.38720 379387 Sinularia abhishiktae S parulekari NTM C13989 684967 Sinularia parulekari S ornata ZMTAU CO34651 684961 Sinularia ornata S_luxuriosa_RMNH_Coel.38742 383977 Sinularia luxuriosa S ornata ZMTAU CO34650 684961 Sinularia ornata S penghuensis ZMTAU CO34706 5231860 Sinularia penghuensis S_humilis_RMNH_Coel.38737 383981 Sinularia humilis S gibberosa ZMTAU CO33611 3679260 Sinularia gibberosa S polydactyla ZMTAU CO34106 514624 Sinularia polydactyla S muralis NTM C13978 161917 Sinularia muralis S densa NTM C1993 1079236 Sinularia densa S compressa ZMTAU CO34140 314108 Sinularia compressa S ornata NTM C14138 684961 Sinularia ornata S peculiaris ZMTAU CO34683 S heterospiculata NTM C14003 787445 Sinularia heterospiculata S variabilis NTM C14134 334772 Sinularia variabilis S heterospiculata NTM C13968 787445 Sinularia heterospiculata S abrupta NTM C14012 3679277 Sinularia abrupta S compressa ZMTAU CO34142 314108 Sinularia compressa accDQ280512 606345 Sarcophyton ehrenbergi S erecta ZMTAU CO34144 838567 Sinularia erecta S woodyensis NTM C14557 960310 Sinularia woodyensis S_foliata_RMNH_Coel.38732 383983 Sinularia foliata S penghuensis ZMTAU CO34739 5231860 Sinularia penghuensis S_sobolifera_RMNH_Coel.38748 751464 Sinularia sobolifera S_flexibilis_RMNH_Coel.38378 921124 Sinularia flexibilis S_acuta_RMNH_Coel._38721 909310 Sinularia acuta S vrijmoethi NTM C14095 334777 Sinularia vrijmoethi S penghuensis ZMTAU CO34630 5231860 Sinularia penghuensis S polydactyla NTM C14142 514624 Sinularia polydactyla S dura NTM C13808 838570 Sinularia dura S_compressa_RMNH_Coel.38420 314108 Sinularia compressa S_crassa_RMNH_Coel.38430 314106 Sinularia crassa S peculiaris ZMTAU CO34707 684959 Sinularia peculiaris S capitalis NTM C14530 955592 Sinularia capitalis S cristata NTM C13818 314100 Sinularia cristata S maxima NTM C14512 1050401 Sinularia maxima S variabilis NTM C14164 334772 Sinularia variabilis S fungoides NTM C13910 473262 Sinularia fungoides S confusa NTM C14456 909318 Sinularia confusa S gardineri ZMTAU CO34097 473266 Sinularia gardineri S bremerensis NTM C14488 909316 Sinularia bremerensis S penghuensis ZMTAU CO34681 5231860 Sinularia penghuensis S slieringsi ZMTAU CO34654 3679344 Sinularia slieringsi S_depressa_RMNH_Coel.38428 314098 Sinularia depressa S leptoclados NTM C14492 213052 Sinularia leptoclados S querciformis ZMTAU CO34191 514618 Sinularia querciformis S querciformis ZMTAU CO34096 514618 Sinularia querciformis S_procera_RMNH_Coel.38386 1040556 Sinularia procera S brassica NTM C13660 955594 Sinularia brassica S diffusa NTM C14464 383989 Sinularia diffusa S lamellata NTM C13824 213054 Sinularia lamellata S erecta ZMTAU CO33585 838567 Sinularia erecta S wanannensis ZMTAU CO34700 5231861 Sinularia wanannensis S notanda NTM C14555 962995 Sinularia notanda S molesta ZMTAU CO33615 161919 Sinularia molesta S hirta ZMTAU CO34100 787443 Sinularia hirta S_nanolobata_RMNH_Coel.38441 962993 Sinularia nanolobata S scabra NTM C14043 1041087 Sinularia scabra S cruciata ZMTAU CO34152 314102 Sinularia cruciata S numerosa NTM C13790 684963 Sinularia numerosa S penghuensis ZMTAU CO34691 5231860 Sinularia penghuensis S wanannensis ZMTAU CO34704 5231861 Sinularia wanannensis S ornata ZMTAU CO34646 684961 Sinularia ornata S_longula_RMNH_Coel.38439 383979 Sinularia longula S ornata ZMTAU CO34647 684961 Sinularia ornata S_crebra_RMNH_Coel.38726 1059556 Sinularia crebra S_curvata_RMNH_Coel.38436 1059559 Sinularia curvata S soongi ZMTAU CO33632 5231870 Sinularia soongi S lamellata NTM C13931 213054 Sinularia lamellata S_flaccida_RMNH_Coel.38731 383991 Sinularia flaccida ot:undefined Maximum likelihood tree1_ROOT tree1_ROOT false true true true true true true true true true true true true true true true true false true true true false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true false true true true true true true true true true true true true true true true true true true false true true true true true true true true true true false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true false true true true true true true true true false true true true true true ot:undefined Maximum likelihood tree2_ROOT tree2_ROOT false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true false true true true false true true true true true false true false true false true false true false true false true false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true false true false true true true true true true true true true true true true true true true true true true ot:undefined Maximum likelihood tree3_ROOT tree3_ROOT false true true true true true true true true true true true true true true false true false true true true false true true true true true true true true true true true true true