pythonVersion 2.7.9 pythonImplementation CPython All life false Source data for tree(s) 'tree1' tree1 ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar ^ot:isTaxonExemplar otu112 otu113 otu85 otu86 ^ot:comment ^ot:branchLengthTimeUnit ^ot:nodeLabelMode ^ot:nodeLabelTimeUnit rootedge tree1 Mark Westneat 769569 Pomacentridae false ot_951 W. James Cooper, Lydia L. Smith, Mark W. Westneat, 2009, 'Exploring the radiation of a diverse reef fish family: Phylogenetics of the damselfishes (Pomacentridae), with new classifications based on molecular analyses of all genera', Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 52, no. 1, pp. 1-16 2009 Lepidozygus tapeinosoma 1043102 Lepidozygus tapeinosoma Stegastes imbricatus 729158 Stegastes imbricatus Abudefduf sparoides 893440 Abudefduf sparoides Abudefduf sexfasciatus 49236 Abudefduf sexfasciatus Abudefduf lorenzi 318928 Abudefduf lorenzi Abudefduf abdominalis 809329 Abudefduf abdominalis Abudefduf hoefleri 779763 Abudefduf hoefleri Abudefduf saxatilis 405751 Abudefduf saxatilis Abudefduf troschelii 961357 Abudefduf troschelii Chrysiptera galba 94172 Chrysiptera galba Chrysiptera starcki 196298 Chrysiptera starcki Chrysiptera glauca 615599 Chrysiptera glauca Stegastes partitus 345269 Stegastes partitus Chrysiptera caeruleolineata 553943 Chrysiptera caeruleolineata Chrysiptera unimaculata 205784 Chrysiptera unimaculata Chrysiptera brownriggii 196199 Chrysiptera brownriggii Chrysiptera brownrigii 196199 Chrysiptera brownriggii Chrysiptera leucopoma 674629 Chrysiptera leucopoma Pomachromis fuscidorsalis 1090044 Pomachromis fuscidorsalis Pomachromis richardsoni 729143 Pomachromis richardsoni Dischistodus pseudochrysopoecilus 402650 Dischistodus pseudochrysopoecilus Dischistodus chrysopoecilus 999634 Dischistodus chrysopoecilus Dischistodus melanotus 145798 Dischistodus melanotus Stegastes planifrons 665837 Stegastes planifrons Dischistodus perspicillatus 431579 Dischistodus perspicillatus Dischistodus prosopotaenia 858443 Dischistodus prosopotaenia Cheiloprion labiatus 356942 Cheiloprion labiatus Chrysiptera parasema 737555 Chrysiptera parasema Chrysiptera rex 1045543 Chrysiptera rex Chrysiptera cyanea 43505 Chrysiptera cyanea Chrysiptera taupou 145794 Chrysiptera taupou Chrysiptera hemicyanea 145801 Chrysiptera hemicyanea Chrysiptera oxycephala 205774 Chrysiptera oxycephala Chrysiptera springeri 205779 Chrysiptera springeri Stegastes leucostictus 100830 Stegastes leucostictus Chrysiptera rollandi 553951 Chrysiptera rollandi Chrysiptera talboti 145804 Chrysiptera talboti Hemiglyphidodon plagiometopon 145788 Hemiglyphidodon plagiometopon Amblyglyphidodon aureus 681010 Amblyglyphidodon aureus Amblyglyphidodon leucogaster 893449 Amblyglyphidodon leucogaster Amblyglyphidodon curacao 100399 Amblyglyphidodon curacao Amblyglyphidodon indicus 393624 Amblyglyphidodon indicus Acanthochromis polyacanthus 100410 Acanthochromis polyacanthus Altrichthys azurelineatus 230809 Altrichthys azurelineatus Neoglyphidodon oxyodon 441861 Neoglyphidodon oxyodon Stegastes variabilis 323173 Stegastes variabilis Neoglyphidodon polyacanthus 323192 Neoglyphidodon polyacanthus Neoglyphidodon melas 778858 Neoglyphidodon melas Neoglyphidodon nigroris 778861 Neoglyphidodon nigroris Neoglyphidodon thoracotaeniatus 205763 Neoglyphidodon thoracotaeniatus Premnas biaculeatus 519096 Premnas biaculeatus Amphiprion ocellaris 674643 Amphiprion ocellaris Amphiprion percula 681007 Amphiprion percula Amphiprion latezonatus 797739 Amphiprion latezonatus Amphiprion clarkii 674637 Amphiprion clarkii Amphiprion akallopisos 166934 Amphiprion akallopisos Stegastes adustus 323181 Stegastes adustus Amphiprion perideraion 674640 Amphiprion perideraion Amphiprion sandaracinos 432684 Amphiprion sandaracinos Amphiprion chrysopterus 741436 Amphiprion chrysopterus Amphiprion leucokranos 797748 Amphiprion leucokranos Amphiprion polymnus 432681 Amphiprion polymnus Amphiprion sebae 741446 Amphiprion sebae Amphiprion akindynos 166957 Amphiprion akindynos Amphiprion mccullochi 797745 Amphiprion mccullochi Amphiprion frenatus 674634 Amphiprion frenatus Amphiprion ephippium 370818 Amphiprion ephippium Stegastes diencaeus 729161 Stegastes diencaeus Amphiprion melanopus 45635 Amphiprion melanopus Amphiprion rubrocinctus 797742 Amphiprion rubrocinctus Amphiprion chrysogaster 741433 Amphiprion chrysogaster Amphiprion allardi 166954 Amphiprion allardi Amphiprion latifasciatus 1039138 Amphiprion latifasciatus Amphiprion bicinctus 274300 Amphiprion bicinctus Amphiprion omanensis 741443 Amphiprion omanensis Amphiprion chagosensis 797751 Amphiprion chagosensis Amphiprion nigripes 741440 Amphiprion nigripes Pristotis obtusirostris 493813 Pristotis obtusirostris Microspathodon chrysurus 847660 Microspathodon chrysurus Teixeirichthys jordani 519089 Teixeirichthys jordani Chromis dasygenys 515505 Chromis dasygenys Neopomacentrus taeniurus 395 Neopomacentrus taeniurus Neopomacentrus anabatoides 3635448 Neopomacentrus anabatoides Neopomacentrus bankieri 732810 Neopomacentrus bankieri Neopomacentrus miryae 145784 Neopomacentrus miryae Neopomacentrus sindensis 145778 Neopomacentrus sindensis Neopomacentrus azysron 1045534 Neopomacentrus azysron Neopomacentrus nemurus 145775 Neopomacentrus nemurus Neopomacentrus cyanomos 431606 Neopomacentrus cyanomos Microspathodon dorsalis 205758 Microspathodon dorsalis Neopomacentrus filamentosus 145781 Neopomacentrus filamentosus Chrysiptera annulata 893432 Chrysiptera annulata Amblypomacentrus breviceps 3635625 Amblypomacentrus breviceps Amblypomacentrus clarus 729167 Amblypomacentrus clarus Chrysiptera kuiteri 205772 Chrysiptera kuiteri Chrysiptera tricincta 3635463 Chrysiptera tricincta Pomacentrus leptus 668529 Pomacentrus leptus Pomacentrus pavo 566204 Pomacentrus pavo Pomacentrus alleni 306497 Pomacentrus alleni Pomacentrus caeruleus 306500 Pomacentrus caeruleus Hypsypops rubicundus 847666 Hypsypops rubicundus Pomacentrus auriventris 622070 Pomacentrus auriventris Pomacentrus coelestis 622060 Pomacentrus coelestis Pomacentrus sulfureus 443964 Pomacentrus sulfureus Pomacentrus trichourus 62785 Pomacentrus trichrourus Pomacentrus arabicus 919425 Pomacentrus arabicus Pomacentrus baenschi 443961 Pomacentrus baenschi Pomacentrus trilineatus 1090040 Pomacentrus trilineatus Pomacentrus burroughi 205795 Pomacentrus burroughi Pomacentrus grammorhynchus 668547 Pomacentrus grammorhynchus Pomacentrus adelus 668541 Pomacentrus adelus Mecaenichthys immaculatus 847673 Mecaenichthys immaculatus Abudefduf luridus 502949 Abudefduf luridus Pomacentrus albicaudatus 205769 Pomacentrus albicaudatus Pomacentrus amboinensis 880239 Pomacentrus amboinensis Pomacentrus moluccensis 622057 Pomacentrus moluccensis Pomacentrus bankanensis 622067 Pomacentrus bankanensis Pomacentrus philippinus 668524 Pomacentrus philippinus Pomacentrus vaiuli 323178 Pomacentrus vaiuli Pomacentrus australis 668538 Pomacentrus australis Pomacentrus reidi 668521 Pomacentrus reidi Pomacentrus chrysurus 622063 Pomacentrus chrysurus Pomacentrus nagasakiensis 668535 Pomacentrus nagasakiensis Similiparma hermani 356949 Similiparma hermani Altrichthys curatus 729155 Altrichthys curatus Pomacentrus milleri 668527 Pomacentrus milleri Pomacentrus lepidogenys 668544 Pomacentrus lepidogenys Pomacentrus stigma 729149 Pomacentrus stigma Pomacentrus smithi 1090037 Pomacentrus smithi Pomacentrus alexanderae 205792 Pomacentrus alexanderae Pomacentrus nigromarginatus 729152 Pomacentrus nigromarginatus Pomacentrus brachialis 323189 Pomacentrus brachialis Pomacentrus nigromanus 668532 Pomacentrus nigromanus Plectroglyphidodon johnstonianus 919431 Plectroglyphidodon johnstonianus Plectroglyphidodon dickii 1045539 Plectroglyphidodon dickii Plectroglyphidodon phoenixensis 919443 Plectroglyphidodon phoenixensis Plectroglyphidodon imparipennis 919434 Plectroglyphidodon imparipennis Plectroglyphidodon leucozonus 778904 Plectroglyphidodon leucozonus Plectroglyphidodon randalli 919440 Plectroglyphidodon randalli Stegastes apicalis 729138 Stegastes apicalis Stegastes obreptus 519101 Stegastes obreptus Parma microlepis 628063 Parma microlepis Parma oligolepis 323186 Parma oligolepis Stegastes gascoynei 732815 Stegastes gascoynei Stegastes fasciolatus 931161 Stegastes fasciolatus Pomacentrus agassizii 919428 Pomacentrus agassizii Stegastes altus 519092 Stegastes altus Chromis brevirostris 1050528 Chromis brevirostris Chromis ternatensis 779781 Chromis ternatensis Chromis viridis 674650 Chromis viridis Chromis atripectoralis 741423 Chromis atripectoralis Chromis caerulea 794483 Chromis caerulea Plectroglyphidodon lacrymatus 778892 Plectroglyphidodon lacrymatus Nexilosus latifrons 1043094 Nexilosus latifrons Chromis flavomaculata 318936 Chromis flavomaculata Chromis notata 511580 Chromis notata Chromis chrysura 477758 Chromis chrysura Chromis fumea 674653 Chromis fumea Chromis nitida 477764 Chromis nitida Chromis insolata 196304 Chromis insolata Chromis alta 501317 Chromis alta Chromis punctipinnis 433119 Chromis punctipinnis Chromis abyssus 1050524 Chromis abyssus Stegastes pelicieri 443953 Stegastes pelicieri Chromis circumaurea 327735 Chromis circumaurea Chromis chromis 845473 Chromis chromis Chromis limbata 1020295 Chromis limbata Chromis analis 674646 Chromis analis Chromis woodsi 1092663 Chromis woodsi Chromis xanthopterygia 809332 Chromis xanthopterygia Chromis weberi 809315 Chromis weberi Chromis xanthochira 830295 Chromis xanthochira Chromis earina 239325 Chromis earina Chromis alpha 779769 Chromis alpha Stegastes lividus 519104 Stegastes lividus Chromis degruyi 327731 Chromis degruyi Chromis cadenati 617441 Chromis cadenati Chromis opercularis 779776 Chromis opercularis Chromis xanthura 779750 Chromis xanthura Chromis atrilobata 436999 Chromis atrilobata Chromis cyanea 47358 Chromis cyanea Azurina hirundo 553979 Azurina hirundo Chromis multilineata 437016 Chromis multilineata Dascyllus aruanus 49239 Dascyllus aruanus Dascyllus melanurus 622079 Dascyllus melanurus Stegastes nigricans 392 Stegastes nigricans Dascyllus flavicaudus 271143 Dascyllus flavicaudus Dascyllus marginatus 271147 Dascyllus marginatus Dascyllus reticulatus 622075 Dascyllus reticulatus Dascyllus carneus 845464 Dascyllus carneus Dascyllus albisella 845469 Dascyllus albisella Dascyllus strasburgi 27343 Dascyllus strasburgi Dascyllus trimaculatus 312258 Dascyllus trimaculatus Chromis acares 393615 Chromis acares Chromis nigrura 393606 Chromis nigrura Chromis vanderbilti 393610 Chromis vanderbilti Stegastes albifasciatus 443940 Stegastes albifasciatus Chromis dimidiata 393618 Chromis dimidiata Chromis margaritifer 809309 Chromis margaritifer Chromis atripes 741426 Chromis atripes Chromis iomelas 847679 Chromis iomelas Chromis agilis 45652 Chromis agilis Chromis retrofasciata 477818 Chromis retrofasciata Chromis retrofaciata 477818 Chromis retrofasciata Chromis caudalis 433122 Chromis caudalis Chromis amboinensis 42582 Chromis amboinensis Chromis ovatiformes 779772 Chromis ovatiformis Stegastes limbatus 443948 Stegastes limbatus Abudefduf declivifrons 659926 Abudefduf declivifrons Abudefduf concolor 659932 Abudefduf concolor Abudefduf taurus 961374 Abudefduf taurus Abudefduf septemfasciatus 129790 Abudefduf septemfasciatus Abudefduf notatus 893446 Abudefduf notatus Abudefduf sordidus 1053071 Abudefduf sordidus Abudefduf whitleyi 893458 Abudefduf whitleyi Abudefduf bengalensis 318931 Abudefduf bengalensis Abudefduf vaigiensis 1053067 Abudefduf vaigiensis Abudefduf margariteus 893443 Abudefduf margariteus ot:changesCount Maximum likelihood node1 node1 false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true false true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true true