pythonVersion
2.7.9
pythonImplementation
CPython
All life
false
Source data for tree(s) 'tree1'
tree1
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
^ot:isTaxonExemplar
otu112
otu113
otu85
otu86
^ot:comment
^ot:branchLengthTimeUnit
^ot:nodeLabelMode
^ot:nodeLabelTimeUnit
rootedge
tree1
Mark Westneat
769569
Pomacentridae
false
ot_951
W. James Cooper, Lydia L. Smith, Mark W. Westneat, 2009, 'Exploring the radiation of a diverse reef fish family: Phylogenetics of the damselfishes (Pomacentridae), with new classifications based on molecular analyses of all genera', Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 52, no. 1, pp. 1-16
2009
Lepidozygus tapeinosoma
1043102
Lepidozygus tapeinosoma
Stegastes imbricatus
729158
Stegastes imbricatus
Abudefduf sparoides
893440
Abudefduf sparoides
Abudefduf sexfasciatus
49236
Abudefduf sexfasciatus
Abudefduf lorenzi
318928
Abudefduf lorenzi
Abudefduf abdominalis
809329
Abudefduf abdominalis
Abudefduf hoefleri
779763
Abudefduf hoefleri
Abudefduf saxatilis
405751
Abudefduf saxatilis
Abudefduf troschelii
961357
Abudefduf troschelii
Chrysiptera galba
94172
Chrysiptera galba
Chrysiptera starcki
196298
Chrysiptera starcki
Chrysiptera glauca
615599
Chrysiptera glauca
Stegastes partitus
345269
Stegastes partitus
Chrysiptera caeruleolineata
553943
Chrysiptera caeruleolineata
Chrysiptera unimaculata
205784
Chrysiptera unimaculata
Chrysiptera brownriggii
196199
Chrysiptera brownriggii
Chrysiptera brownrigii
196199
Chrysiptera brownriggii
Chrysiptera leucopoma
674629
Chrysiptera leucopoma
Pomachromis fuscidorsalis
1090044
Pomachromis fuscidorsalis
Pomachromis richardsoni
729143
Pomachromis richardsoni
Dischistodus pseudochrysopoecilus
402650
Dischistodus pseudochrysopoecilus
Dischistodus chrysopoecilus
999634
Dischistodus chrysopoecilus
Dischistodus melanotus
145798
Dischistodus melanotus
Stegastes planifrons
665837
Stegastes planifrons
Dischistodus perspicillatus
431579
Dischistodus perspicillatus
Dischistodus prosopotaenia
858443
Dischistodus prosopotaenia
Cheiloprion labiatus
356942
Cheiloprion labiatus
Chrysiptera parasema
737555
Chrysiptera parasema
Chrysiptera rex
1045543
Chrysiptera rex
Chrysiptera cyanea
43505
Chrysiptera cyanea
Chrysiptera taupou
145794
Chrysiptera taupou
Chrysiptera hemicyanea
145801
Chrysiptera hemicyanea
Chrysiptera oxycephala
205774
Chrysiptera oxycephala
Chrysiptera springeri
205779
Chrysiptera springeri
Stegastes leucostictus
100830
Stegastes leucostictus
Chrysiptera rollandi
553951
Chrysiptera rollandi
Chrysiptera talboti
145804
Chrysiptera talboti
Hemiglyphidodon plagiometopon
145788
Hemiglyphidodon plagiometopon
Amblyglyphidodon aureus
681010
Amblyglyphidodon aureus
Amblyglyphidodon leucogaster
893449
Amblyglyphidodon leucogaster
Amblyglyphidodon curacao
100399
Amblyglyphidodon curacao
Amblyglyphidodon indicus
393624
Amblyglyphidodon indicus
Acanthochromis polyacanthus
100410
Acanthochromis polyacanthus
Altrichthys azurelineatus
230809
Altrichthys azurelineatus
Neoglyphidodon oxyodon
441861
Neoglyphidodon oxyodon
Stegastes variabilis
323173
Stegastes variabilis
Neoglyphidodon polyacanthus
323192
Neoglyphidodon polyacanthus
Neoglyphidodon melas
778858
Neoglyphidodon melas
Neoglyphidodon nigroris
778861
Neoglyphidodon nigroris
Neoglyphidodon thoracotaeniatus
205763
Neoglyphidodon thoracotaeniatus
Premnas biaculeatus
519096
Premnas biaculeatus
Amphiprion ocellaris
674643
Amphiprion ocellaris
Amphiprion percula
681007
Amphiprion percula
Amphiprion latezonatus
797739
Amphiprion latezonatus
Amphiprion clarkii
674637
Amphiprion clarkii
Amphiprion akallopisos
166934
Amphiprion akallopisos
Stegastes adustus
323181
Stegastes adustus
Amphiprion perideraion
674640
Amphiprion perideraion
Amphiprion sandaracinos
432684
Amphiprion sandaracinos
Amphiprion chrysopterus
741436
Amphiprion chrysopterus
Amphiprion leucokranos
797748
Amphiprion leucokranos
Amphiprion polymnus
432681
Amphiprion polymnus
Amphiprion sebae
741446
Amphiprion sebae
Amphiprion akindynos
166957
Amphiprion akindynos
Amphiprion mccullochi
797745
Amphiprion mccullochi
Amphiprion frenatus
674634
Amphiprion frenatus
Amphiprion ephippium
370818
Amphiprion ephippium
Stegastes diencaeus
729161
Stegastes diencaeus
Amphiprion melanopus
45635
Amphiprion melanopus
Amphiprion rubrocinctus
797742
Amphiprion rubrocinctus
Amphiprion chrysogaster
741433
Amphiprion chrysogaster
Amphiprion allardi
166954
Amphiprion allardi
Amphiprion latifasciatus
1039138
Amphiprion latifasciatus
Amphiprion bicinctus
274300
Amphiprion bicinctus
Amphiprion omanensis
741443
Amphiprion omanensis
Amphiprion chagosensis
797751
Amphiprion chagosensis
Amphiprion nigripes
741440
Amphiprion nigripes
Pristotis obtusirostris
493813
Pristotis obtusirostris
Microspathodon chrysurus
847660
Microspathodon chrysurus
Teixeirichthys jordani
519089
Teixeirichthys jordani
Chromis dasygenys
515505
Chromis dasygenys
Neopomacentrus taeniurus
395
Neopomacentrus taeniurus
Neopomacentrus anabatoides
3635448
Neopomacentrus anabatoides
Neopomacentrus bankieri
732810
Neopomacentrus bankieri
Neopomacentrus miryae
145784
Neopomacentrus miryae
Neopomacentrus sindensis
145778
Neopomacentrus sindensis
Neopomacentrus azysron
1045534
Neopomacentrus azysron
Neopomacentrus nemurus
145775
Neopomacentrus nemurus
Neopomacentrus cyanomos
431606
Neopomacentrus cyanomos
Microspathodon dorsalis
205758
Microspathodon dorsalis
Neopomacentrus filamentosus
145781
Neopomacentrus filamentosus
Chrysiptera annulata
893432
Chrysiptera annulata
Amblypomacentrus breviceps
3635625
Amblypomacentrus breviceps
Amblypomacentrus clarus
729167
Amblypomacentrus clarus
Chrysiptera kuiteri
205772
Chrysiptera kuiteri
Chrysiptera tricincta
3635463
Chrysiptera tricincta
Pomacentrus leptus
668529
Pomacentrus leptus
Pomacentrus pavo
566204
Pomacentrus pavo
Pomacentrus alleni
306497
Pomacentrus alleni
Pomacentrus caeruleus
306500
Pomacentrus caeruleus
Hypsypops rubicundus
847666
Hypsypops rubicundus
Pomacentrus auriventris
622070
Pomacentrus auriventris
Pomacentrus coelestis
622060
Pomacentrus coelestis
Pomacentrus sulfureus
443964
Pomacentrus sulfureus
Pomacentrus trichourus
62785
Pomacentrus trichrourus
Pomacentrus arabicus
919425
Pomacentrus arabicus
Pomacentrus baenschi
443961
Pomacentrus baenschi
Pomacentrus trilineatus
1090040
Pomacentrus trilineatus
Pomacentrus burroughi
205795
Pomacentrus burroughi
Pomacentrus grammorhynchus
668547
Pomacentrus grammorhynchus
Pomacentrus adelus
668541
Pomacentrus adelus
Mecaenichthys immaculatus
847673
Mecaenichthys immaculatus
Abudefduf luridus
502949
Abudefduf luridus
Pomacentrus albicaudatus
205769
Pomacentrus albicaudatus
Pomacentrus amboinensis
880239
Pomacentrus amboinensis
Pomacentrus moluccensis
622057
Pomacentrus moluccensis
Pomacentrus bankanensis
622067
Pomacentrus bankanensis
Pomacentrus philippinus
668524
Pomacentrus philippinus
Pomacentrus vaiuli
323178
Pomacentrus vaiuli
Pomacentrus australis
668538
Pomacentrus australis
Pomacentrus reidi
668521
Pomacentrus reidi
Pomacentrus chrysurus
622063
Pomacentrus chrysurus
Pomacentrus nagasakiensis
668535
Pomacentrus nagasakiensis
Similiparma hermani
356949
Similiparma hermani
Altrichthys curatus
729155
Altrichthys curatus
Pomacentrus milleri
668527
Pomacentrus milleri
Pomacentrus lepidogenys
668544
Pomacentrus lepidogenys
Pomacentrus stigma
729149
Pomacentrus stigma
Pomacentrus smithi
1090037
Pomacentrus smithi
Pomacentrus alexanderae
205792
Pomacentrus alexanderae
Pomacentrus nigromarginatus
729152
Pomacentrus nigromarginatus
Pomacentrus brachialis
323189
Pomacentrus brachialis
Pomacentrus nigromanus
668532
Pomacentrus nigromanus
Plectroglyphidodon johnstonianus
919431
Plectroglyphidodon johnstonianus
Plectroglyphidodon dickii
1045539
Plectroglyphidodon dickii
Plectroglyphidodon phoenixensis
919443
Plectroglyphidodon phoenixensis
Plectroglyphidodon imparipennis
919434
Plectroglyphidodon imparipennis
Plectroglyphidodon leucozonus
778904
Plectroglyphidodon leucozonus
Plectroglyphidodon randalli
919440
Plectroglyphidodon randalli
Stegastes apicalis
729138
Stegastes apicalis
Stegastes obreptus
519101
Stegastes obreptus
Parma microlepis
628063
Parma microlepis
Parma oligolepis
323186
Parma oligolepis
Stegastes gascoynei
732815
Stegastes gascoynei
Stegastes fasciolatus
931161
Stegastes fasciolatus
Pomacentrus agassizii
919428
Pomacentrus agassizii
Stegastes altus
519092
Stegastes altus
Chromis brevirostris
1050528
Chromis brevirostris
Chromis ternatensis
779781
Chromis ternatensis
Chromis viridis
674650
Chromis viridis
Chromis atripectoralis
741423
Chromis atripectoralis
Chromis caerulea
794483
Chromis caerulea
Plectroglyphidodon lacrymatus
778892
Plectroglyphidodon lacrymatus
Nexilosus latifrons
1043094
Nexilosus latifrons
Chromis flavomaculata
318936
Chromis flavomaculata
Chromis notata
511580
Chromis notata
Chromis chrysura
477758
Chromis chrysura
Chromis fumea
674653
Chromis fumea
Chromis nitida
477764
Chromis nitida
Chromis insolata
196304
Chromis insolata
Chromis alta
501317
Chromis alta
Chromis punctipinnis
433119
Chromis punctipinnis
Chromis abyssus
1050524
Chromis abyssus
Stegastes pelicieri
443953
Stegastes pelicieri
Chromis circumaurea
327735
Chromis circumaurea
Chromis chromis
845473
Chromis chromis
Chromis limbata
1020295
Chromis limbata
Chromis analis
674646
Chromis analis
Chromis woodsi
1092663
Chromis woodsi
Chromis xanthopterygia
809332
Chromis xanthopterygia
Chromis weberi
809315
Chromis weberi
Chromis xanthochira
830295
Chromis xanthochira
Chromis earina
239325
Chromis earina
Chromis alpha
779769
Chromis alpha
Stegastes lividus
519104
Stegastes lividus
Chromis degruyi
327731
Chromis degruyi
Chromis cadenati
617441
Chromis cadenati
Chromis opercularis
779776
Chromis opercularis
Chromis xanthura
779750
Chromis xanthura
Chromis atrilobata
436999
Chromis atrilobata
Chromis cyanea
47358
Chromis cyanea
Azurina hirundo
553979
Azurina hirundo
Chromis multilineata
437016
Chromis multilineata
Dascyllus aruanus
49239
Dascyllus aruanus
Dascyllus melanurus
622079
Dascyllus melanurus
Stegastes nigricans
392
Stegastes nigricans
Dascyllus flavicaudus
271143
Dascyllus flavicaudus
Dascyllus marginatus
271147
Dascyllus marginatus
Dascyllus reticulatus
622075
Dascyllus reticulatus
Dascyllus carneus
845464
Dascyllus carneus
Dascyllus albisella
845469
Dascyllus albisella
Dascyllus strasburgi
27343
Dascyllus strasburgi
Dascyllus trimaculatus
312258
Dascyllus trimaculatus
Chromis acares
393615
Chromis acares
Chromis nigrura
393606
Chromis nigrura
Chromis vanderbilti
393610
Chromis vanderbilti
Stegastes albifasciatus
443940
Stegastes albifasciatus
Chromis dimidiata
393618
Chromis dimidiata
Chromis margaritifer
809309
Chromis margaritifer
Chromis atripes
741426
Chromis atripes
Chromis iomelas
847679
Chromis iomelas
Chromis agilis
45652
Chromis agilis
Chromis retrofasciata
477818
Chromis retrofasciata
Chromis retrofaciata
477818
Chromis retrofasciata
Chromis caudalis
433122
Chromis caudalis
Chromis amboinensis
42582
Chromis amboinensis
Chromis ovatiformes
779772
Chromis ovatiformis
Stegastes limbatus
443948
Stegastes limbatus
Abudefduf declivifrons
659926
Abudefduf declivifrons
Abudefduf concolor
659932
Abudefduf concolor
Abudefduf taurus
961374
Abudefduf taurus
Abudefduf septemfasciatus
129790
Abudefduf septemfasciatus
Abudefduf notatus
893446
Abudefduf notatus
Abudefduf sordidus
1053071
Abudefduf sordidus
Abudefduf whitleyi
893458
Abudefduf whitleyi
Abudefduf bengalensis
318931
Abudefduf bengalensis
Abudefduf vaigiensis
1053067
Abudefduf vaigiensis
Abudefduf margariteus
893443
Abudefduf margariteus
ot:changesCount
Maximum likelihood
node1
node1
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
false
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true